Basic Information
Symbol
hsa_HIPK3_0002800
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0021594
hsa_circHIPK3_006
hsa-HIPK3_0083
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33307959-33358740
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33286413-33337194
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-350.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-378.4 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
398.45
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((.(((((((...((((..((((.(.((((((((......(((.((..((((((..((((((((((((.((((..........(((((((((((((((..(((.(((.((...)).)))..))).((((.(((((((((.....((((((((..((.(((((.......)))))))...))))))))......))))))))))))).((....))))))))))((((((.((((((..(((((((((((((((......(((.((.(((((.........))))).))))).....((..((......))..)).(((((.......((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..)))).....)))))((((((((((((((.(((((........).))))..))).)))))))).)))((((...((((((.....))))))))))..(((.(((..(((((...)))))..))).))))))))))).........((((......))))((((.....)))))))))))...)))...)))...))))))............((((((((((.....)))))))).)))))))))((((((((((..((((((((((((((((....(((..((....(((........)))...)))))))))))))..((.(((((((((...(((...((.(((((.((((............))))..))))).))...))).)))))).))).))..........))))))))...))))..))))))...(((((((((.(((((((((..(((((.....((((((...............((((((........))))))((((....((((.(((........)))))))....))))...........))))))..)))))..)))..((((((......((((((..((((((.......((((((((..((...))..))))))))...))))))..))))))))))))))).)))...))))))))))))).))).)))...))))))....)))))))).)))......))).))))).))))).)))).))))))).)))))).....(((((((((.(((...((((((....)))))).)))..)))))))))((((.(((((((((((((((.((((((......))).)))..))).....))))))((((.(((((((...........(((((((.....)))))))...))))))))))).((.(((....))).)).)))))).))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((.(((((((...((((..((((.,.(((((((,..,.,,(((.((..((((((..(((((({{((((,(({({{......||((((((({(((((((.,((,,(((.{{...,,.}}}..||..((((.(((((((((.....((((((((..{,,(((((.......})))},).}.))))))))......))))))))))))).}},.}}},)))))))|(((((,,((((,,..{((({({(((({,,..,,}},(((.((.(((((.........})))).)))))||}}.||..{{....,|||,{|}.(((((..,{...((((..(((..((.(((((....(((...)))......))))).))..)))..))))..,,.))))){({(((((((((((.((({{{{..,,,.}.))))..))),,))))))).})|{|||,,,{{{{{{.....)))}})))},..((((((({(((((.((.....,.{{...)).......)).))))))..))))))}..,{{,((((({{{{.,|||,,|{(((({.,,,}}})))}..}}}........,..,,,,{{{{((((((..,,,})|||}}).}},)))))}||||{|||||..||||||{,{(((((((,,,.({{..{{,,..{{,,,,.....))),..,.}}}))))))))..((.(((((((((...(((...((.(((((.{({{,..,......,.})}}..))))).))...))).)))))).))).)),,,,,..,|||}}})))).,,))},{{{{{,,{{{{,(({({{,{,..,|||}}|}.}}}}..))}}}|||..}}}}...........,,}}))).}}}..({{{...}}}}....{{{{,{{|,,,,...,))})))).))}))}))),..........|||||||||}}..,,|..(((({(,.....((((((..((((((..,....((((((((..((...))..)))))))),..))))))..))))))})})))}||,|,},.,}},}})))))))),})}}}))}}.}}}}}|,,,.||}}}}}}.}))..,..,)))})}))}.))))).)))).))))))).)))))).....(((((((((.(((...((((((....)))))).)))}.)))))))))((({.((((((((((({((({.(((,,.,,...,,...,,.,}))}.}))))))))||{{,{{(((({,...,||,...(((((((.....))))))).,,|}|}|||}}},.{{.{||,...})),)).}))))).)))),.......
Forensic Context
No forensic context available.