ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_chr9_0040600
Basic Information
Symbol
hsa_chr9_0040600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0141
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
9:107619355-107619778
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104857074-104857497
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-292.00
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-295.71
kcal/mol
Frequency:
0.0024
Diversity:
19.37
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
(((((((((((((.((((.((((.((((.((((((((((((.((((((.((((((((((.(.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.((((.((((((((((((((((((.(((.(((.(((.((((((.((((.((((((((((((((((.((((((...(((((....((((...))))......)))).)...)))))).)))))))))))))))).)))).)))))).))).))).))).))))))))))).))))))).)))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))).)))))).))).))))))))).)))).)))).)))).)))))))))))))(((((...)))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
(((((((((((((.((((.((((.((((.((((((((((((.((((((.((((((((((.(.(((((.((((((((((((((((((((((((((((((..((((((((((((.((((.((((((((((((((((((.(((.(((.(((.((((((.((((.((((((((((((((((.((((((...(((((,,..{({,...||}}...,,,)))).)...)))))).)))))))))))))))).)))).)))))).))).))).))).)))))))))))})}))))).)))).))))))))))))..))))))))))))))))))))))))))))))))))).).)))))))))).)))))).)))}})))))))).)))).)))).)))).)))))))))))))((({{...}})....))
Forensic Context
No forensic context available.