Basic Information

Symbol
hsa_HIPK3_0008300
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0021606 hsa_circHIPK3_020 hsa-HIPK3_0009
Host gene
HIPK3
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:33368839-33370833 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:33347293-33349287 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-271.3 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -286.8 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 166.86
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.(((.(((((((((((((((.(((((..............(((((((((((((((((...((((.....))))....)))))))(((((((.((((((((.....)))..))).(((((((.(((((.((((((.....(((((..(((((((.(.(((((....)))))).))))...)))..))))).)))))).))).)).))))))))))))))))........((((((((..((((((..(.(((((((.(.....).))))))).)..))))))....))).)))))..(((((....))))).....))))))))))..............)))))..)))).)))).)))(((((((((.((......(((((((...........(((((........))))))))))))........))..)))).))))).....(.(((((((((((((....((.((((((.(((......)))))).....))).))....))))))))))))).).............((((........(((((.((..(((.......))).((((((........(((.....))).((((((.....((((((((((....((((((......))))))......)))))......)))))(((((..........)))))((((((.....(((((.((((((((((.((..((((((........)))))).(((((...)))))..))))))))))))))).)).......)).))))............)))))).(((((((((((.......))))).))))))........))))))...(((((...)))))..))))))).((((......)))).))))..)))).)))))(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.(((.((((,{(((((((((.(((((,{.,.,,.......(((((((((((((((((...((((.....))))....})))))}(((((((.{{{({(((.....)))..}}}.(((((((.(((((.((((((.....(((((..(((((((.,.(((((....)))))).))))...)))..))))).)))))).)))}}).))))))))})))))))........((((((((..((((((..(.(((((((.(.....).))))))).)..))))))....))).)))))..(((((....))))).....)))))))))).......,,,.,.})))))..)))).))))},)|(((((((((.((......(((((({..........,(((((........))))))))))))........))..)))).))))),....(,(((((((((((((....((.(((((,{(((......))))}}.....))).))....)))))))))))))}}.............(((,..,.,...(((({,((..(({,,.,{{,.||.((((((........(((.....))).((((({...,,((((((((((,,..((((((......))))))..,,..)))))}......}}})(((({..........}))))(((({,..}})||(((.((((((((((.((.,{,{{{{.,|,,...)))})}.(((((...))))),.},))))))))))))).}}.,.....||,|}}},..,...,....)))))).(((((((((((.......))))).))))))........))))))...||,,|}},,}}))..))))))).((((......)))).}},}..)))).)))))(.....)
Forensic Context

No forensic context available.