Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0001500
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0021717 hsa_circCD44_006 hsa-CD44_0084
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35208379-35219793 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35186832-35198246 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-122.9 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -134.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 116.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((.((((((((...(((((.(((..........((((((((...((((........))))(((....))).......(((((....)))))(((((((((((.(..(((((.......(((((((.((((.....(((........)))..)))).........((.((((((........)))))).)).)))))))((((............))))......)))))..).))((((..(((.......)))...)))).......((((..((.....))..))))...(((((((((((((....)))).(((...)))(((.((((((((.((......(((((.......))))))).)))))))))))..))))))))).......(((((((((..........((..(((((((((..........)))))((((((....))))))))))..)).......)))))))))..(((........)))....))))))))).)))))))).))))))))..)))))..))).))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((.((({((((...(((({{(({..,...,,..((((((((..,,(((.....,,,|,,{(((....)))}...}},|{(((....)))}}(((((((((((.{..{({((...,,,{(((((((.((((.....(((........)))..)))).,,,.....{{.((((((........)))))).)).)))))))|(({............})),.}}},.}))))..,.},{{{(,,(((.......)))..,))}}.......{{{{..({,,,..,}.,))))...((((((((({({,...,|||}.,,|,..)))(((.((((((((.((,.....{((((.......))))))).)))))))))))..))))))))).......(((((((((........,.,,..(((({((({..,...,...}))),((((((....))))))))))..))..,....)))))))))..(((........)))..,,))))))))),)))))))).}}})))))..})))),.))).))).....
Forensic Context

No forensic context available.