Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0006100
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0021725 hsa_circCD44_017 hsa-CD44_0016
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35219668-35229753 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35198121-35208206 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-159.7 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -174.4 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 226.58
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((...((((((.......((((((....))))))......)))))).........((((((((.......(((..(((((((((((((.(((......(((((........)))))(((..((((((((...(((.(((((...((((((.((((......(((........)))......))))......(((..(((...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((.......((((....))))...........((((...)))).........(((...((.(((..(((((...)))))..))))).))).........)))))).((.(......))).......))))))))..)))).)))...)))...)))))).....))))).)))....))))))..))..)))....))).................((((...........)))).(((((......)))))........((.(((.......))).))....(((((((((((((((....((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))((((.....((((.(((....)))...))))....))))..))).)))..............)))))))))...)))))))).))))))))..))))))))))(......)
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,.{{((((((.......((((({..,,||}}}),,,...))))))...}|,,},|(({((((...,...,,|,.{{{{{(((({,{{.,({,{{{,{(,{({{{,,,,..}})))|{||.,,{{{{{{...(({.{(({(,(((((,,{.(({{......(((........)))......)))).....|||||,{{{...((((...((((((((((((.((.((....)).)).)))){(((((,.....,(({,....||||,.....{,...((((...)))).,.,.....{{{..,((.(((..(((((...)))))..)))},.)}).........)))))}.,,.......,||,....,,,))))))))..)))).},,...,}}..{|....))....))))),)))....,|||||{.||.{||,............,}}.........{(((...........)))}.{((((......))))).....,.}||}|||,,}}}..}},.||......||,||||}|||||.}.,|(((((..,((({.,((((..((({.,,,.........})))..))))..}}}}.{}|||,.((((,.{{.,{{({{{(....))),,},,.,..,.)))).,)}}.}}},....{{,,,{...}))))))}}},})),,}}},}}),.)})},,)))))))}.,,......,
Forensic Context

No forensic context available.