Basic Information

Symbol
hsa_CD44_0006200
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0021726 hsa_circCD44_018 hsa-CD44_0009
Host gene
CD44
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:35219668-35231601 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:35198121-35210054 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-184 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -197.18 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 148.98
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.....((((((.......((((((....))))))......))))))...((..((((..((((.((((.((....))...))))...(((((.((.(((.(((((.((....((((((((...((((((...(((.(((((...((((((.((((......(((........)))......))))......(((..(((...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((.......((((....))))...........((((...)))).........(((...((.(((..(((((...)))))..))))).))).........)))))).((.(......))).......))))))))..)))).)))...)))...)))))).....))))).)))....))))))..)).))))))...............(((((..((((...........))))..(((((..((((.(((........((.(((.......))).)).........)))...))))....((((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..))))))((((((.((...((...(((.(((..(((....((((..(((((.................))))).))))....)))..))).)))))...)))))))).........))))).(((.....)))....))))))).)))))))).)).)))))..(((((..................))))).))))..))))...))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.....((((((.......((((((....))))))......))))))...((..((((..((((.,{{{.....,,|,...})))..,(((((.{(.(((.(((((.((,...((((((((...((((((...(((.(((((.({(((,,{.((((......(((........)))......)))).....}|||}.{{{...((((...((((((((((((.((.((....)).)).))))((((((......,(({,....||||,.,...{,...((((...))))...,.....{{{..,((.(((..(((((...)))))..)))},.))).........)))))).,,.......,||,....,,,))))))))..)))).}},...,},..{|,,,,)}....))))).)))....))))))..)).))))))................{{{{.,((((...........)))}..(((((.,((((.(((.......,((.(((.......))).)).,.......)))...)))).,..{(((((...((((..((((..((((.............))))..))))..))))..)))))}((((((.((...((..{({{.(((..{{{....,{({.,,{|{|.,||.....{{,,,{..,})))}))}},,,})}},})}},),.))...)))))))).........))))).(((.....))).||}}}})))).)))))))).)).)))))}.(((((.....,............))))).))))..))))...))
Forensic Context

No forensic context available.