Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0012100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0088
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
9:107623960-107666052 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104861679-104903771 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-210.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -221.40 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 115.61
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((((((((((.(((((((.((((((((((((((((..........))))))))).(((((((((.((.(((((((.(((((...((((.(((((.(((((..(..((.((.(((.(((((((....(((...(((...((((..(((((.(((...((((((((((......))))).))))).....))).)))))))))...)))..)))...))))..))).)))))..))..)..))))).....))))).))))......)))))))))))).))(((((...))))).(((((...((.((((....)))).))...)))))..(((((((.....(((((((.((((....))))))))))).)))))))..............)))))))))..(((((((((((((.....((..((((((.........))))))..)).(((((.....))))))))....))))))))))..)))))))..((.((((((.((((((....)).))))....)))))).))(((((((..((..((......))..)).))).)))).................(((((...)))))..)))))))..)))))..))))))..(.....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((((((((((.(((((((.((((((((((((((((..,....,..))))))))).(((((((((.((.(((((((.(((((...((((.(((((.{(((({.({{(({(({((({,((.,.,..,,|||,,,{((...((((..(((((.{{{...((((((((((......)))))},)))).....}}}.)))))))))...})}..,.,..}))))})))),}}},,...|,,|..}}})),,...))))).))))......)))))))))))).))(((({...})))).((({{,,,((,{({,....}}}}.))...})))),,((({{{(.....(((((((.((((....))))))))))).}))})))..............)))))))))..((((((((((,(({..,.((..((((((.........))))))..)).(((((.....))))),),.}}}))))))))))..)))))))..((.((((((.((((((....)),})))....)))))).))(((((((..({{{(((.....)))))).))).))))............,....({{{,.,.})))}..)))))))..)))))..))))))..(.....)
Forensic Context

No forensic context available.