Basic Information

Symbol
hsa_SRGAP1_0010000
RNA Class
circRNA
Alias
hsa_circ_0098964 hsa_circSRGAP1_030 hsa-SRGAP1_0107
Host gene
SRGAP1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
12:64474066-64521504 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
12:64080286-64127724 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-352.4 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -380.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 236.56
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...((((((........(((((((((((.(((((((((....(..((((.((....)).))))..)..((((((((((((..(((((((..((((((((((((...(((((((((((((.((((((...((....(((((.(((((..((....)).(((...)))...((((...))))....)))))..)))))....)).)))))).(((...)))...)))..))))..........)))))).....))))))))))))...........(((((.(((((..(((((((((((((...(.(((......((((((((..................))))))))))).)..)))))))))))))))))).))))).((((((..(((.......))))))))).(((...((((((.((.((((...(((..((....)))))(((((((...)))))))........((((((.......))))))(((((.....))))))))).)).))))))....)))..........))))))).)))))...)))))))...)))))))))))).....))))))))((.(((((...(((..((...))..)))....))))).))..(((((((.(.((((((.(((((.(((...((((((((.(((((.........)))))))).)))))...))))))))((((((.((((.................)))).)).))))...........((((...........))))))))))..).)))))))...((((((((((..(..........)..))).)))))))....((((((((((.((((((((((...........((((..((((.(((((.((((((.(((.((..(((..((........)).)))..))..))).))).))))))).).))))))))...))).)))))))((.((((.....)))).))..)))...))))))).))))))..(((((.(((.(((.....(..((((((.((((((((((((...)))))))......((((.((((...((..(((.......)))..)).)))).))))....(((.((.((.......)).)).)))..(((..(((...((.(((((......))))).))...)))..)))...)))))))))))..)))).))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
...((((((........((((((((({.((((((((((....{..((((.((....}).))))..}..((((((((((((..(((((((..((((((((((((,..((((({(((((.{.((((((.,,,,.,,.(((((.(((((,.((....)).{{{...}}}...((({...})))..},)))))..))))).}},)).)))))).|,,.,}).},.,|||..{{....,}},},..})))))...,.))))))))))))...........(((((.(((((..(((((((((((((...{.(((,,{(({,,,..}}}}.||{{{{{.........,))))}}}}}).}..)))))))))))))))))).))))),((({{{..{{{.......})}})}}}}{({(,,.((((((.({.{{{{.,.{{{.,{|....)))}}(((((((...)))))))........((((((.......))))))(((((.....)))))}})),}).)))))}....)))...,,.....))))))).)))))}..}))))))...))))))))))}}.....)))))))),{.,{{{({{{(((..,,...},..))}....,))))})}..((((((({..((((((.(((((((((...((((((((.(((((.........))))))))))})))...)))))))}((((((.((((.................)))).)),,))).,.......,,{(({.,,{,....}}))))))))))..),)))))))...((((((((((..(..........)..)))))})))))....((((((({{,,((((((((((...........(((({.{(((.(((((.((((((.((,.((..(((..((........)).)))..))..))).))).))))))).).))))))))...))).)))))))|{.((((.....)))).},..,))...))))))).))))))..(((((..((.{{{.,{{.{..(((((,{((((((((({((,,,|||}}}}......((((.((((...((..(((.......)))..)).)))).))))....,,,.,,.|||}||||},}.}}.}}},.{{{..(((...((.(((((......))))).))...)))..}})...)))))))))))..}))).))}.)))))
Forensic Context

No forensic context available.