Basic Information

Symbol
hsa_AMOTL1_0001600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0024049 hsa_circAMOTL1_003
Host gene
AMOTL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:94528177-94599333 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:94795011-94866168 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-858.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -898.42 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 524.05
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((((((((......)))....((.((((((....((((((.(..(((((((.(((.((((((.....(((((((.(((.(((((((((((((((....((......)).(((((.(((..(((((((..(((((((..((((((..(((((...))))).))))))....))))...(((((.((((...))))))))).......((..(((((..((((.((((.((((.((.....)).)))).)))))))).)))))..)).((((.(((....)))))))......)))..)))))))......((((((.(((((..(((((((..(((((.(.((..............((((((.....))))))............(((((.......))))).....((..((((((.....((((..(((.......)))..)))).......)))).))..))....)).).)))))..((.(((((.(.(((((..(((....(((((..((....))..)))...)).....)))..))))).)..))))).))(((.((((....((..((((((.(((((((.((.((((.(((...(((((.((..(((.(((......((((........)))).....))))))..)).)))))..)))((((((..((((..(((((.(((.(((............))).))).))))).(((((...)))))......))))..))))))((((.((((((((((((................((((.(((((..((..(((((((....(((((.((((....)))))))))(((((((........)).)))))......(((((.(((.....))).))))).....(((((.((...((((.......))))))........(((((((((..........((((.....)))))))...))))))......))))))))))))..))...))))))))).(((.((((.((.(((((......(((((....(..(((((........)))))..)..)))))....))).)).)).)))).)))......(((....)))..))))))).))))))))).........))))..)).))))))).))))))))..)))).)))..)))))))..)))))...)))))).....))).)))))((((.((((.........(((((((.(((...((((((((.((.(((((((((.......(((..(.((((......((((...((((..((.((((...)))).))..))))...)))))))).)...)))......))))))))).((((((.......))))))..((((((((....((((((..(((((((..((((.((((((.((((...))))))).....................))).))))..)))))))....)))))).((((....))))..))))))))..........(((((...((....))....)))))......))))))))))...))).))))))).)))))))))))))))))))))))...)))....)))))))....))))))..)))...)))))))..).(((((....))))).....))))))..))).)))))...((((((((((.((.(((..........)))..)))))))))).))..(((((((((((.(((.((((((..((...(((((((.(.............((((((((.((.......)).))))))))).)))))))....))........(((((((((((...((((((..((((((((.(((.(((((.............))))).....((((....((((......)))).))))............(((((((((((((.((.((((.((((((...((((........))))..)))......((.((........)).)).))).)))).)).))))).((((.(..((((.....(((((((...(((.((((...)))).))).(((.(((((................)).))).))).)))))))...))))..).))))))))).)))......((((((.....(.((((.(.((.((((((((.(((.....)))..((.((((((.................))))))))..((((((((.........))))))))..)).)))))).)).)..)))).).....)))))).........)))))))))))...)))).))...)))))))))))(((((((....)))).)))......))))))...))).)))))).)))))((((....))))..........(((.........)))))))))))).)....
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((((((((......}}},,,,{{.((((({{{{.((((((.{..(((((((.(((.{((((({....(((((((.(((.(((((((((((((((....{({{{{..|,.(((((,(((..{{,{,,|,.{{.((((,,(((((({{(((({..,|}}}},,}}}}},,,,||||...{(((,,((((...)))))))))||.....{{..(((((..((((.((((.((((.({.....}).)))).)))))))).)))))..||.((((.(((....)}})))),,....,,..,|||,|{|{{....,,,,,,.|||||..|||{|||.,(({||.,,|,,|}}}...,,,,,,||||{|}},..||},,.,|{,.,,...|.(((((.......))))).,..||...,,{|||.....|||{.,|||.......}))..||||{{....{||,,.||......}},,,)))})))}),|.|{|{{,}}}}}.....(((((((((({,.{,....,}|.,{{....}}...,}.)))))))))).{{||{|.|{,({.((.((....)).)).((((((,{|(((((((((........{(((((((((((..((((((..(.((((..(((.(((((((.,((((((,........,.)))))||((((..((((..(((((.(((.(((............))).))).))))).(((((...)))))......))))..))))},((((.((((((((((((...{,...........(({{.{((((,,((..(((((((....({{((,((((....)))))))})(((((((........)).)))))......(((((.(((.....))).))))).....(((({.{{...,{,{,,.....|||,,,..}}}...(((((((((..........((((.....)))))))...))))))......))))))))))))..)),,.}}}}}}}}},(((.((((.((.(((((.{,...(((((....{..(((((........)))))..}..)))))..,})))},).)).)))).)},......{{{....))}..))))))).))))))))).}}))}}))..))))))))..))).))).))))}))))))))....,,,,})).,))))))||||,,,}}},,.)))})))))}||{}||||}{{{.....(((((({.(((...((((((((.((.{((((((((..,..,.(((..,.((((......((((...((((..((.((((...)))).))..))))...)))))))).,...))).}.,..))))))))|{(((......}}}}}||||.{.{(((((((.,..((((((,{(((((((..((((.(((((,{((((...)))))))......,,.............))).))))..))))}}},,,})))))).{{((....)))}..))))))))}..}}.},..{((((...,|,,..}}.,,,}}}}),.....))))))))))...))).})))))).),)))),.)))))))))))))))...)))...}}})))))....)),)))}.)))...)))))))..}.(((((....))))).....})))))..,)},},}.,...{{((((((((.((.(((.,......,.)))..)))))))))).}}..((((({(((((.(((.((((((..((...(((((((.,.............{(((((((.((.......)).)))))))))})))))))....}).......{(((((((((((...((((((..((((((((.(((.(((((...,.....,...))))).....,,{(,...((((......)))}.,,}}|,{,........(((((((((((((.((.((((.((((((...{(((........)))),,||}....,,||.{(.,......)).}}.))).)))).)).))))).((((.{..((((.....(((((((...(((.((((...)))).))).{(({(,(({................)).))).,)}.)))))))...))))..).))))))))).))).....|((((((.....(.((((.(.((.((((((((.{({.....)))..((.((((((.................))))))))..((((((((.......,.))))))))..)).)))))).)).)..)))).).....)))))),........))))))))))).,.)))).))...)))))))))))|{{((((....)))).))}......))))))...})).})))}}.}}}}|((((....))))},}}......,||..,,,,...}}}))))))))).)....
Forensic Context

No forensic context available.