Basic Information
Symbol
hsa_chr11_0655400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AMOTL1_0022
Host gene
AMOTL1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:94526700-94527829
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:94793534-94794663
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-289.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-311.65 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
347.12
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((....((((((((.....((((((((.((..((((((((.(((((((((.((...(((((((...........)))))))..((((((.(((((......))))).(((.(((((.(((.((((....(((((.((((((((((..((((((...))))))..............))).)))))))..)))))....)))).)))..)))))))))))))).((((((((((...((.....))...)))))))))))).)))))))))..................(((((((((.........)))))))))((((.(((((((((((...)))).............((((.((.((((..(.(((....))).)..)))))).))))..(((....((((..(....)..)))).)))..((........)).(((((((..(((.(((((......))))).))))))))))....))))))).)))).............(((......))).........................))))))))..)).))))))))..(((((...............)))))(((((.((((((..(((((.((((..(((....))).)))).)))))..))......)))).)))))........((((((......))))))))))))))((((((((((((((..............(((..((((((((....)))))))).))))))).....((((.((((((.(((((((((((((....)))))))).....................(((((((..........(((((........(((...(((....))))))........)))))..........)))))))........((.((((((...)))))))).))))).))))))))))...................)))))))))).((((......)))).....(((...((((((...(((((((..(((((........)))))..)).)))))....))))))...)))...))))))))((.....(((.(((((....(.((.....)).)......))))).)))....))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((((((({{..((((((((,,{.{((((((((.((,,((({(((,.,{(((({{{.{{.|,|{((({|.,.........}}})}}}..((((((.(((((......))))).(({.(((((.(((.((((....(((((.((((((((((..((((({...}))))).......,....,,))).)))))))..)))))....)))).)))..)))))))))))))).{(((((((((...((.....)}.,.))))))))))}},)))))}}||.{,......||,|,...,(((((((((.........)))))))))|{{,.,((({{,((((...)))).....,,,,,,..,{{{.((.((((..{.{((.,..))}.)..)))))).)))},}}))}}.}}||,,}|..}})}}||||||||..{..{{{{,.,{{{({(((((,.(((.(((({......))))).)))))))))}.,..}}}}})},}}}}.........,,,,(,({,{,..,,}.....,{..,.....|||,,.....}}))))))..}).)))))}}}..{{(((,....((,,,,,...,,,}}(((((.(((({{..(((((.((((..(((....))).)))).)))))..,,......)))).))))).......{((((((.....,)})))))}}}}}}}{{{||||{|||||{|,.....,},....{{{..((((((((....)))))))).}}}|||||,,,,{({(,{{{,,({(((((((((((((....)))))))))))))}..............,|||{{||,,,|||,..,{{,,..,,.,,..,||...{{|}}},}))))}.|.||...}}})),.,}})}}.,)))),,,},,}}.,,||.((((((...)))))))){||.||{||||,,||,..,,......,,,..{{{{,||}|},,,}}.((((......)))).,(((((....{{((((,...((({(,,,((|||},,}....}))))..,.,}))))),,,})))}}...{||.{{|}||,,,,,,}}}}}|||.|||||}},.}}|{.....},,)})....,,,))})))...,))
Forensic Context
No forensic context available.