Basic Information

Symbol
hsa_AMOTL1_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AMOTL1_0060
Host gene
AMOTL1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
11:94554696-94587247 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:94821530-94854082 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-246.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -264.56 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 205.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((..(((....)))..)))....((((..((......))..))))(((((((((.((...(((((..((((....)))).(((((.((((((((((((((((((((((((((.((((((.(((....))).)))...((((.((((.........(((((((.(((...((((((((.((.(((((((((.......(((..(.((((......((((...((((..((.((((...)))).))..))))...)))))))).)...)))......))))))))).((((((.......))))))..((((((((....((((((..(((((((..((((.((((((.((((...))))))).....................))).))))..)))))))....)))))).((((....))))..))))))))..........(((((...((....))....)))))......))))))))))...))).))))))).))))))))...((((.((((..........(((((........)))))..........))).)..))))(((((....))))).....))).))))))).))......((((((((((.((.(((..........)))..)))))))))).)).((((((...(((.(((.(....).)))..((...(((((....((((....)))).))))).)))))...))))))(((...)))..))).)))))).)..)))..)))))))))...)))))...)))))).))).))(((((.............)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,.{{{{.(({({,{(((((({{{(((...((((..((......))..}})){{(((,.,,.((((((((((.,((((,...|}||..,,{||{{{||{||,{{{,,,,(({({(((((,((((((.(({....}))}))||,,((({.((((.........(((((({.(((...((((((((.((.{((((((((..,..,.(((..,.((((......((((...((((..((.((((...)))).))..))))...)))))))).,...))).}.,..))))))))|{(((......}}}}}||||.{.{(((((((.,..((((((,{(((((((..((((.(((((,{((((...)))))))......,,.............))).))))..))))}}},,,})))))).{{((....)))}..))))))))}..}}.},..{((((...,|,,..}}.,,,}}}}),.....))))))))))...))).})))))).)})))))}...{{((.{(((..........(((((........)))),..........))),)..)))}||||{,,,,)))))..,,.))).)))))))}),......((((((((((.((.(((.,......,.)))..)))))))))).))..}}|))}})))).,,...}}).},.{{...{{{{{||,,.............((((((((.((......,)}.)))))))))})))))))....)),....,.))))))))))))...,,}}..}})))))).).}.,.(((((...,.....,...)))))..
Forensic Context

No forensic context available.