ForensicRNA
Home
Atlas
Index
Marker Scope
|
About
Feedback
ForensicAgent
Home
Index
hsa_ABCA1_0013900
Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0013900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0066
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107656971-107657452
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104894690-104895171
UCSC (hg38)
External Database
circbank
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-120.40
kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-130.15
kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
98.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
COPY
((((((((((.((((......))))..)))..((.(((((.(((((.((((((....(((((....)))))((((((((((..(((((((((......(.((((...(((((((((......((((.(((((..((((..(((....)))..)))).....))))).))))(((((((((...((((...((((((((....))))))))...)))).)))))))))..........))).))))))..)))).))))))))))..)))))...))))).((((.(((((((((((.....((((.........)))).......))))))).))))))))((((((.((.((....)).).).)))))))))))).)).)))))))).)).))))))).((((..((((..(((((.....)))))..)))).))))....(((.(((((.((.((........))..)).))))).))).
Thermodynamic Ensemble Prediction
COPY
((((((((((.((((......))))..)))..((.(({((((((,{.(((((({,..{((((....}}}},((((({(({{((((((((((({.....,.{(((...(((((((((......((((.(((((..((((,.(((....)))..)))).....))))).))))(((((((((...((((...((((((((....))))))))...)))).)))))))))..........)))}}))))).,)))).))))))))))})))))),,.}}}}}.{(((.((({,((({({,|,..((((.........)))).......}))}))).))))))}}((((({.,,.||},..}}.},}.)))))))))))).}}.)))))))).)).))))))).((((..((((..(((((.....)))))..)))).))))....(((.(((((.((.((........))..)).))))).))).
Forensic Context
No forensic context available.