Basic Information

Symbol
hsa_chr11_0655600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-AMOTL1_0035
Host gene
AMOTL1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
11:94559839-94560609 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
11:94826673-94827443 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-201.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -215.13 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 190.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((...(((((((..((((((...)).))))...)))))))...))))((((.((((((((.(((....(((....(((((((.((((((........(((.(((((((...((((.(((((.((((((((((((...))))).))))...((((((((...)))).))))..(((...)))))).))))).)))).)).))))).))).........(((((.((...((((((..(((..((.((((.....(((((...)))))....)))).))........))).)))))))).))))))))))))))))))...)))..(((...((((((((.(((((((..((.((((.....((((((...((...))...)))))).......(((..(((((..........((((((((.((....(((.......))).......)).)))))))).)))))..)))(((((((..(((((((.....(((((.................(((((......))))).((((.....((((..(((.............))).))))....))))...(((.....))).)))))......))))))))))))))....((((((((((....((.....))....)))).))))))(.(((((((..(((....)))..........(((((((((....)))))))))))))))).))))).)).)))))))..))))))))))).)))))))).....)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((...(((((({..(((({{...||.))))...})))))}...))))((((.(({{{((({{{{....{((,...(((((((.(((((({..,.,.,((({(,(((.....,||,,,||||}||{(((((((((...})))).))))...((((((((...)))).))))..{((,.,||||||.,}))).}))}.,},,.,,|,|||.......,.||||{.({,,.((((((..(((..((.((((.{.,.(((({...)))))..,.)))).))......,.))).)))))),},)))))))))))))))))).).})).|{((.,.((((((((.(((((((..((.((({.....((((((...{{...}}.,.)))))}..,,...(((..(((((..........((((((((.((....(((.......})).......)).)))))))).}))))..)))(((((((..(((((((.....(((({.................(((((......))))).{(({.....{{{({,(((.,.........,.))).)))}.,,,}}}}...(((.....))).)))))...,..))))))))))))))....{(((({{(((....{{|,...}),,..)))).))))))|.(((((((..,,,,,,.}}}......,...(((((((((....)))))))))))))))).,)))),)}.)))))))..)))))))))))})))))))),,,..)))))))
Forensic Context

No forensic context available.