Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0014000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0058
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107661125-107662175 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104898844-104899894 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-316.20 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -335.21 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 241.54
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((((((((((...(((((((((.......((......))....)))))..((((..((........))..))))..((((((((...((((((((((((((((((((.((...(((((((...(((....)))......)))).)))...))...))))))))))((((..(((((.....((.(((((..(((.....)))..))))).))..))))).))))((((((.(((((((((.((((((((((((....(((.....)))..(((((((....(((.......))).......))))))).))))))))))))((((.....)).))..((((((((.....................((((((.......)))))))))))))).((((..........))))....(((.......)))((((((((...(((((....)))))..)))).))))))))))))))))))).((((.......((((((((((((((......)))))))).....)))))).......))))((((....))))....((((((.((((.((.......)))))).)))))))))))).....))))))))))))...))))....)))))))))).))((...((((((((((((((..(((((((.................)))))))...))))).....)))))))))....(((((..((((.(.(((((((....(((((........)))))...........((((((.(((((((..........))))))).))))))....(((((.((((.(((.(((((((.(((((((((((..((((......(((((((.(((((.((((....)))).)))))..)))))))...))))....))))....((((((((((((.......................))))))))....)))).........))))))).))))))).))).)))).)))))))))).)).).)))).)))))..(((.......))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((((((((((...(((({{{{{,,..,(,((,,,,..}|,|,,||}}|{.((((,.(((....),}},..)))).}|{{|||||...{||||||||(((((((((((.((...(((((((.....(,....}},.....)))).)))...))...))))))))))|(((..(((((.....((.(((((..{(,.....)))..))))).))..))))).)))}((((((.(((((((((,((((((((((((....(((.....)))..(((((((....(({.......))).......))))))).))))))))))))((((.....)),||{.(((((((((,..,,{.{{,....,}}}.}||((((.......)))))))))))))),|||{..|....,..}}}}....(((.......}}}{(((((((...({{{{....)))))..)))).))))))))))))))))))).((((.......((((((((((((((......)))))))).....)))))).......))))((({....})))....{{{{{{.,{{,.({,,{.,{.}}},,},)))))),|||||,.|||}}}}))))))}}...))))....)))))))))).})((...((((((((((((((..(((((((.{...........,.,.)))))))...))))).....)))))))))....(((({.,,(((.(.((((((((((((((((....))}.)})))))}},,,..,.((((((.(((((((..........))))))}.)))))}.,..(((((.((((.(((.(((((({.(((((((,,,,.,(({(....,.{((((((.(((((.((((....)))).)))))..))))))),..)))).,..||||,...||||((((((((.......................))))))))....,,,,.........))))))).))))))).))).)))).)))))})))).)).).)))).)))))..{({.......})}.))
Forensic Context

No forensic context available.