Basic Information

Symbol
hsa_ANKRD11_0003300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKRD11_0011
Host gene
ANKRD11
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
16:89371614-89374137 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:89305206-89307729 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-188.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -197.78 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 185.83
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(..((((.(.(((.((((((.........((((((.((((.(((.(((.(((((.(.(((..((((......)).(((.((((...)))))))))..))).).))))).))).))).)))))))))))))))).))).).))))..)......((.(((.(((((.((((((.....))))))..((((((((.((((((((((((((((((.(((.((((......))))...(((((((((((((((..(((((((((((((((((.((((((......((((.(((((..(((...(.((........)).)..))).)))))))))))))))......))).)))..))).))))))))...((.((.((.(((.......))).)).)).)))))))).....)).)))))))))).))))))....(((..(....)..))).(((.((....))))))))))))).)))).)))..)))))........))))))).).)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
.{..{..((((.(.(((.((((((.........((((((.((((,(((.(((.{((((,(.(((.,({{{.,{{.|||.(((.{{{{..,))))}))}}..))).).}}})},))).))}.})))))))))}})))}.))).).))))..,......{{,.((.(((((.((((((.....))))))..(((({(((.(((((((((((({{{{(({(({.((,,||.|{{||,|...(((((((((((((((,,{(((((((((((({{({{{,......{{||,|||.,}))),}|}),.,,||,,{,...{({{{,..,,}}}}}}||||..,||||.,,,,..,..}}},,})}.)))))))}..,{{.((.{{.(((.......))).}}.)).}))))))).....)).))))))),.),}|}}},..|,|||..|}..})..))).||,,((....)))}))))))))).)))).)))..)))))..,.....))))))).}.}}.
Forensic Context

No forensic context available.