Basic Information

Symbol
hsa_ANKRD12_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0108948 hsa_circANKRD12_011 hsa-RP11-21J18_0001
Host gene
ANKRD12
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
18:9182380-9235907 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
18:9182382-9235909 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-274.90 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -301.38 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 344.03
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...((((((((..(((((.((((.((((((((((((((....((((((..((((...(((((.((((.....))))...(((((((....)))))))..((....)).(((((((......)))))))...................)))))))))..))))))....(((((...(((......)))..)).)))((.((((((.........))).))).)).........(((((((((....((..((((((......((((........))))......)))......((((..(((....)))....)))))))..))........(((((((...((((...((.......))...))))....)))))))......))))))))).((((.........))))...)))))))).))))))((((((.(((((..((((............(((((.((((..(((((((...(((....(((....))).....((((.(((..(..(((..(((((....(((..(((((......(((((...(((((((((((((....(((......(((................(((((((((.....))))).)))))))....)))...))))))............)))))))....)))))..)))))..)))...)))))..)))..)...)))))))..(((((((((((..((((((((((((.......))))))))).)))....)))).)))).)))(((....))).........(((((...((.((((((((((((((.((.((((((((.((.(((((.....(((..(((((.....)))))..)))..(((((....)))))....(((.............)))))))).))....)))))))).))..)))).)))))).((.(((.........))))).((((((.......)))))).))))))...))))).)))....))))))))))).))))).((((....))))..(((((..(((((.....)))))...)))))......))))..))).)).))))))..(((((((..(((((..((.(((...))).))..)))))..)..........(((................)))......))))))..((((.(((........))).))))..........)))).)))))..))))))))..)(((((....(((...)))...)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...((((((((..(((((.({{{{((((((((((((((....((((((..{{((,,,{{{{|||||{.....,}}}...(((((((....)))))))..,|....,|.(((((((......)))))))..........,,.....,.,}})}))})..))))))....{({({...,{{....,,|||.,||{,,,((.((((((,,.......})),))).))..,,,,...|((((((((.,,..,..{((,{{......((((........)))}......},|,,...,{{{{..{{{....)))....))))}}}|,,,........(((((((.,.((((...{(,......,)...)))).,..}))))))......}}}))))}}.((((.........)))}...)))))))).))))))}|(({{.{||{{..((((,,..........((({(,(((({.(((,,,,....||}.|,|{{....)))}...{((((,((,{{{{.(((..(((((..,.(((..(((((....,.,,{{(...{{{(({{((((((....{{,.,.....,,.............,..|{{||{{{(.....}))}}.}|}}.||.||.,}}.,,)))))),,|{{,..{{{,|,,,,)),,,.,))))..)))))..))),..)))))..}}},{{{{{||||||,..,.,{{(({{{(..((((((((((((.......))))))))).)))....))}).))||(((((.,...((({(((.{{,....(((((((((.{.,((((((((((.((.((((((((.,{,(((((,{.,.({{..((({{..,,.)))))..))).,,|||{...,))))}....{{{........,,,,.,}||}))).}),}},)))))))).))..)))),}))))).{(,.((......,,.)}}},}.)))))))))..},.))...))))})},.,.))))))).})})))))))))),.}}}},.((((....))))..(((((..{((((...,,)))}}...)))))......}}}}.,))}.}}.}}||||..,,,{|||}||{|||.,|{,|||.,,})),)),,)}}},..},...,,,,.,|||.,...............,..,,,...,,||{({(,{{.,,{..,}}}}},}}.})}},........,)))}.)))))..))))))))..)(((((....(({...}))...)))))
Forensic Context

No forensic context available.