Basic Information

Symbol
hsa_ABCA1_0015500
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ABCA1_0108
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
9:107685229-107686697 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104922948-104924416 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-408.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -436.90 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 447.28
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.........)).).)((((((((((((.((.((....(((((((((((((((((((.(((((..((((((((...(((((((((....((((..........))))...(.(((((......))))).)......((((((((...((((.(((.(((.((((((((.((((...(((....))).)))).)))........))))))))))).)))).((((((.....((((((((...((.(((((....(((((((((...(((((((((((.......((((((((((.((((....)))).))))))))))))))..........(((((....)))))......))))))))))))))))....))))).))...))....)))))).....))))))))))))))...((((((((..(((....(((((((.((((.........((((........))))........)))))))))))...((((...(((....))).))))......(((((((((....))))))))).((((((.(((...(((((((...(((((...(((((((((((.((((((((((((..(((..............)))..))))))....(((((......))))).((.((..(((((....(((........)))......)))))..)).))...((((((........))))))((((((......))))))(((((.....((((....))))...)))))..)))))).)))))...))))))........(((((((........)).)))))..))))).))))...((((((((((((((.(((.(((((((.....((((.((.......)).))))((((((.((..(((.((.........)).))).))..))))))(((((((....((........))....))))))).)))))))(((((((((((((((...(((((.(((...((((...(((.(((........)))))).....))))...))).)))))..)))))...)))).)))))).....)))))))))........(((((((.(((..(((((.....)))))...........(((((((.....)))))))...))).))))))).((.((((((((((..((((..(((....)))..)))).))))((((((((.....((((......)))))))))))))))))).))..))))))))..)))..)))))))))..((((((...))))))..((..((((.((((((((...............)))).((((((.((((((....)))))).))))))..))))))))..)).)))..)))))))))))))))))...))))))))..))))).)))))))))))))))))))....)).)).))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((.((.........)).).)((((((((((((.((.((.,..(((((((((((((((((((.(((((.,((((((((...(((((((((....,,,,.,,,.,,,,,||||....,|||||,,.,,|},,,|.,,,.,,.((((((({...((((.{({.(((,((((({(({(({,...(({....}}),)}}}.}),...,},,,))))))))))}|)))),{(((((.....(((((({{...{{,(((((..,.{((({|{{{,..,((((((({{,..||||,|(((((((((.((((....}))).)))))))))}}))).....|,|,.(((((....))))).}}},}))))))))))))))}),,}}))))),)),,,)},,,,)))))).....))))))))))))))...((((((((..(((....{((((({,((((,.{,,...{((({....,,..,}})}}......))))))))))|{{,,{((,{.{{,....)))}}}))},....{((((((((....))))))))}.((((((.(((.,.{{{{{((,,.(((({...(((((((((((.(((((({{{{{{..,....,,{{{{,,,..,}.},))))),}||.(((....}}}..||||,{((,{{..(({{{....|||,.....,,}},.,,...}}}}}..)).,}...((((((........))))))((((({......}))))){((({.....((((....))))...))))}..)))))).)))))...)))))).......}|||{{((......,,}},|||}|,{|||||{|}}}.{{(((((({((({{,,{{(,.{{{,,.,.....((((.{(.......)).)))).,,{(({((..{{{.,,.........}}.,))}))}.}||}|}||{|{{,....,,.....,,,))},,,))))))))))))}}}{((((((((((((({{,,(((((.(((...{(({.,.{({.(((........))))}}.....}))}...))).))))).,))}}}.,,))))}}}))))...,{|||||||||.,,....|{{{{|{{,||{}||||||||,,,|}}}},}},}},.,,.{((((((.....))))))}...||,.||||,..,((,((((((((((..{{{{}}|||....,||{.,,,...)))((((((((.....((((......)))))))))))).,||||,}}..|)))))}}..}}),,)})))))}}..{{({{|...)))))),.|{..{{|{.{{||,|{,{{{,{,,,,...,,.|,||,{{||||.|||||,.,.,))}))).)))))},,})))))))..)}.)))..)))))))))))))))))...)))))))).,))))).)))))))))))))))))))..,.)).)).))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.