Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0002000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038076 hsa_circABCC1_011 hsa-ABCC1_0004
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16101673-16130460 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16007816-16036603 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-232.31 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -244.29 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 184.47
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((((...((((...((((((...((...(((((((((...(((((......(((((.(((((....(((((.((...)).)))))....)))))))))).......)))))..........(((((......(((((((....................................)))))))..........(((((..((((((...))))))....)))))......)))))..))))))))))).)))))))))).))))).(((((((((.((.((.((.(((((((((((((...((((((.(((.((((((((.......))))))))((((((.((((...((((....))))...)))).))))))))).))))))....))).)))))).(((.(((.(((((..((....((.((((((.....((((((......((((((((.......(((....))).......))))))))...)))))).........))).))).))...))..)))))))).)))....((.((((((.(((((....((((((........((......))(((.(((..((((((.(((.((((((((((....)))).....(((((((.(((((((((((((......))))))....))))))))))).)))))))))..))).))))))..))).)))....))))))...))))).)...))))).)))))).))..)).))...)))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((((...((((...((((((...{,..{(((((((((..,{((,(,...,.{{(((,(({,{.}|,|||||.||},,),.,,,,}....|||}}}},,,.}},...,,,,,..........(((({....,,(((((((.........,||........,,..............))))))).......,..(((((..((((((...))))))....))))).,....,))))..))))))))))}.)))))))))).))))).(((((((((.((,((.,{,{({{((((({(((...((((({.(((.((((((({.......)))))))){((((({((((...((({....}))}...)))).))))))))).})))))....))).)))))).(((.((,{(((((..((..,.,,.((((((.....((((((......((((((((.,,....(((....))).....,.))))))))...)))))).........))).))).,),..))..)))))))).)))....({.((((({.(((({....((((((.....,,.||.....,,|{({.(((..((((((,(((.((((((((((....)))).....((((({(.(((((((((((((......))))))....)))))))}))),)))}})}}}..}}}.))))))..))).))}....))))))..}))))).)...))))).)))}))}))..}).))...)))))))))
Forensic Context

No forensic context available.