Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038078 hsa_circABCC1_014
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16101673-16184445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16007816-16090588 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-951.01 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -994.89 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 662.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....((((((((((((((.((((.((...((.((((((((((((.((.(((...(((((.....)))))))).))))))........((((((((((((..(((((((((((..(((((((((((((((....(((((((....................................)))))))..........(((((..((((((...))))))....)))))((((((...)))))).)))))))........(((((..((.....)))))))((((((.....))))))..(((((((......((((((......((((((.(((.((((((((((.((((...((((....))))...)))).))))))((((((..((.(......).)).))))))...((((((..((....((.((((((.....((((((......((((((((.......(((....))).......))))))))...)))))).........))).))).))...))..))))))...........((((.((((((((.(((((((((((...(((.((((((..((((..(((((((((((((((.((...(((((....))))).))))))((((.(((((((((((((......))))))....)))))))))))((((((.(((...((((((((.((((.(.......).))))))).)))))...))).)))))).))))))).))))...)))).))..))))..)))...)))))))..((((((...(.((((.(((.((((......).)))....))))))).)....))))))(((((((((((((.....((((...((..((.(((((((..(((..........(((((.((....)).))))).)))..))))))).)).)).)))).....)))))))).)))))........)))).))))))))..))))........(((((((......((((((.....))))))(((((.((..(((...(((...((((.(((.(((.(((((((((((((((.......(((((.....((((((...)))))).......))))).....))))).(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..)))))))))))((.(.((((((((((((((((((((((.(((((.........((((((((((((....(((((..((.((....((((..(.(((.(((.....)))))).)..))))....))))...))))).(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))....(.(((((((((((.((.....)).))..)))).)))))))))))).....)))))))))))(((((((((....)).)))...)))).)).)))))))).))).)..)))))))).).))......((((....))))...((((((((((((((((((((((((...((((((.(((.......((((((((.((.(((((((.......).))))))..)).)))))).))........))).))))))..(((((......)))))((((........))))...)))))).))))....)))))).)))))))))))))))))).))).))).)))).)))....))).)))))))..))))))))))))))..)))))).....(((((((.........)))))))....)))))))))))))(((((((.((((((.(((.((......))..))))))))).)))))))))))))))..)))))))))))...(((((...((.(((((....))))).)).)))))))))))))))))......(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))...(((((((.((...)).)))))))(((((.(((((((.((((...(((((........)))))....))).).)))).))).))))))))))...))).))(((((((...((.....))...)))))))..)).).))).))).))).)))))))).)((((((..((((((..((((((((.....(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))).))).......((((((....))).)))..(((....))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).((((((((...................)))))))).)))).))..)))))..)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,..,((((((((((((((.((({.((..{((.((((((((((((.((.{{(,..((((({...,)))))))).))))))........((((((((((((..(((((((((((..((((((((..,,.....,{{{({(({,,(,,...,|||,..,,}},},............,,((((((((((((((...,,,,...{((,(({{{||||,|..,,|||,|(({{{{.,,)}}))),|{{(((({,,,,,|||||}.((((.....))))...((((((.....)))))).,{{{{..((((((,{((,(({{{{{{.....,.}))))))){((((((((({...((({.,,,||}}...||}|.|}}}}}|||{||}}}},|.,}.)})}))}}}{((.{(,{(((((..((....,,.((((((.....{(((((..,...((((((((.,,....(((....))).....,.))))))))...)))))).........))).))).,},..))..))))))}}.))}.....,,|,|||,|||,,.....{((((({...{{{,{({{{{..((((..((((((((((({{,(,.{{(((((((....))))}})).{{(((((.(((((((((((((......))))))....)))))))})))|})){({(((...,|||}|||,((((.(.......).)))))}),||||},,.,}}.,)),)).))))))).))))...)))),)},,)))),.))),,.))))))}...{{{|,..))))..}))))))))}))..))))))))))))))||{.((..((((((((((((.((((({((...}}},,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..)).}},....((((((((..((((({,((((((.{{,,,..{{{,.,,,,.,},...,,,,)))))))}.),}))))...(((((((((((..(((((.(((((.((............}).))))}))))){(((((.,.,...(((((.....((((((...)))))).......)))))...}.)))))}(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)).,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))){{.,.((((((((,(((((((((((((.{((((.,{..,...{(((({{(((((.,,.{((({..,{.{,,,,,({{{..,,|||,{{,.....)))))).},,))))...,}}}}...}||||.(((((((..(((((((({,........)))))))))..)))))))..,,|.(((((((((({.{{.....}),}}..}))).))))),))))))}}}}.}}}))})))))(((((((((....)).)))...)))).)),}))))))).))).,..)))))))).}.}}......((((....))))...)))))))))))..}))))))).......{{{{{{(({.....|||,|{,,{{.((,(((((({.,,,{.{|,|||}|}{{||,|}|||,.,,{{{{{...,,,))))),...{((((......)))))((((........)))).{{|,||.,{.|||,|{{...)))}))|)||)}.}}}.}}},...}}}),)}))}((((({.,((((..((((..(((......)))))))...)))))))))){((((((.........))))))),}}})))))))})))}}|((((((.((((((.((,.((......))..)),)))))).)))))),))))))))..)))))))))))...(((((...((.(((((....))))).)).)))))})))))))))))......(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))...((((({(,{,...,}.)))))))(((((.(((((((.((((...,((({.{,,....)))}}.,,,))).).)))).))).))))))))))...))).))|((((((...({{.,,....}}))))))},})).).))).))),,)).)))))))}.)|{{{|(,.({{(((..{(((((({....,(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).))))))},}}..,,{..((,{,{|||||||.,||..(((....))}.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))).((({.{{{...(((((((...))))))),,,,,))))))){(((|....})))).((((((((.,.,,,...,..,,.....)))))))),)))).)),.))))}.,)
Forensic Context

No forensic context available.