Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0002900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0076081 hsa_circANKS1A_007
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:34949467-35051280 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:34981690-35083503 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-920.14 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -962.62 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 814.82
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..................((.(((((...))))).)).(((((.....((((.(((((((..(((((((((((((((((......(((((.(((..(((....(((....(.((..((....))..)).)......)))....)))..))).)).)))......))))))).((((((((((...(((((..(((((((...(((((..(((........))).)))))..(((.((((((((.(((.((((((((....(((((((.((..(((((((.((((..(((....((.(((((....(((((((.(..(.((((.(((((((......))).)).))((((((((.....((((((.....))))))))).)))))...............)))).)..))))))))......))))).))....)))..))).....).))))))).....(((((((...(.((((((.((((.(((((...(((.((...................................)).)))....)))))))))..((((((.((((.((....))...)))).))))))....((((......))))......)))))).)....)))))))..)).))))).)))))))..))).))).....))))).)))))).((((((((((..((.((((((((((((((.((.(((.((.((.((((........)))).))..)).((((((.......))))))((((.(((((((.((((((((((.((.(((((.(((.((((...(((((.(.(((.((((((..((..(........)..)).))))))))).)..(((.(((..((((((((((((((.....(..(((.((((.......))))....)))..).......))))))..((((((....))))))...........(((((.((..((..........)).)).))))).))))))))..))).)))))).))..)).)).))))))))))..))))(((.....)))......)))))))))))))))))..((.(((((((((.(......).))))).)))).))....))).)).)).)).))))))))))..))..)))).))))))...(((....))).((..(((....)))..)).))))))))))))....))))))))))((((((.((..(((...((((((((((.((((((.(((.......((((((..(((...)))...))))))........((((.......(((((......(((((((.(((((((.(((.....))).)))))))(((.((((((.((((((.((((..(((..(((((((....................(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..)))((((.((((..(((....)).)..))))))))....)))))))(((.(((((........)))))))).........(((((((((..(.(((((.((....((((((((..((((.....))))....)))))))))).))))))..))))))))))))))..)))).......))).)))))).)).)))))).)).)))..)).)))))).((((.((((.....)))).))))....)))))))).....(((((..(((((((((..(((.(((.(.(((.((.((((..((((((((..(((((((((((.((((((((((((.(((((..((((((((.((((.(((..(((..(((((.((((((((....(((((.(((....))).)))))......(((........))).))))))))..))))).)))..))))))).))))..((((...))))....((((.((((((.(((........)))))))))....))))......)))).))).)))).))...)))))))).))))))...)))))..)))))))).(((.....((...((((((((((((.(((.(((...((((((....((((.((.((.(((..........))).)).))...(((..(((((...))).)).)))......((((((...))))))(((((((((((((.((((((.....))))))))....((((...(((((.((.((.(((.......(((((..((.((((.(((...((((.....)))).))).)))).))..))))).(((..((.((......)).))..))))))))))..)))))....))))....).))))))))))(((((((..((..(((((.((..((((......)))).)).))))).))..))))))).)))))))))).))).).))...).)))))))))))..)).....))).)))).)).)......)).).))).)))..)))))).)))..)))))....))..)))))))))))......)))))..(((((((.........)))))))........
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,{..{{{{,.,......((.(((({...})))).)).(((((,....((((.(((((((..((((((((({({(({{(....,.{{{{{.{((,,(((.........,,{.((..{{,,||}}.,||{{{,,,.,|}}.{|{|||.{|||.||,|||,.....|}|||||.{(((((((((...,{((({.,((((({...,,.{{..({,....,,,{|||.,,||}|}||.||||.{(((,((...|||||||,|.,{{{((((,((..((((({{.,{{{}}|||.,..((.{{,{{,|.,(((({(({({{(,({{(,(({((((......)))}.}.}},(((({({,{{..((((((.....))))))..)}.))))..,,,..........}}}|,|,.}}}}}|||,{,.,.|}|||{||..,,|||..||||,...|.||}}||,....,|{||{{{...{,{{|{((.(((,{(((((...(((.((.........,.........................}}.)))....)))))))))..((((((.((((.{{....}}...)))).))))))...,||||..,,,,))})......}}}}}},},.,.,})))))..}},}||}}||},,,}},.})}})}}.....|||||,},||||{{..,,,|||.|}|.}|}||||||||}},,,|,,|||.||.{{.((((........)))),})..)){((((((.......)))))))|||,|||||||}}|||.|||||}||,}}}}|,}},.,|,..||))}}}.,,{{(.(({{({..{{..{........|..}}.))))))))).,,.||||||..||||||,|(((((({.{....}.)))))))}}}})}}))},}))}.}...{{.(((((((((.{,..((((((....))))))...,,....})).)))))).)){{,{({............,|||,{(((|.|{,{{(({({{.((({{{.{|{{|(((|(||(((((.{|,,(((.,(({(,|{{,{,.||})),.})))}})}}},,{||||||||.|||{||.|..|,|(((|..||||||..}}}.},}||||||}.}}}}})},}},,)),,}}},,,.}}|||||||||,|.},|,||},(((....)))..||.||)|))}}},)).,.}))))))))))||((((,((,,(((,..((((((((({{((({{{,(((,....{.((((((..(((...}}}...)))))),.....{,(((({(,....(((({.{{{{{({(((,{.(((({((,(((..,,.|}}.)))))}){({.((((((.((((((.((((..(((..(((((((.........}..........(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..)|}{(((.((((..{{(....)).}..}))))))}}}}.))}}}}}(((,(((((.,....,.})))||}|....||{{,((({{{{({..{|{(({{.{{....{|{{||{{,,|,{({{...,,}}.,..||||}}}}}},||}}}}..}}))))))))})))},)}}),,....,))),))}}}}.)),)))))),)),))),.)),)))))),||||.{{{{...,,)))}.|||}....}}}}}))}...,,|{{{{..{{|||||||,.{{{,|||,|.|{{{(({({{{..((((((((..(((((((((((.((((((((((((.(((((..((((((((.((((.(((..((,..(((((.((((((((,...(((((.(((....))).)))))...,..(((......,})},.))))))))..))))).,))..))))))).))))..((((...))))....((((.((((({{(((........)))))))))....))))......)))).))).)))).))...)))))))).))))))...)))))..)))))))).(((......|}}.((((((({((({.,,..{{,||,||{{,.,,|||||{.((.((.(((..........))).)).))...,,{,||||||.,,)),.,,..........((((({...})))))(((((((((({((.{(((((.....))})))))...{((((.{.(((((,((.(({{{{......,|((((.,{{.((((.(((.,,({{{.....)))).))).)))).}}..))))),|{,.,||,||}},..,)),,).,))})))))))..)}})),..}})))}}.,))))))))))))|{(((((..((..(((((.((..((((......)))).)).))))).))..)))))}}.)))))))))).)))}).}}...}.))))})})))}..}..,,}.)}},}}})}))}}}}|,..||,}.}},.))),.}))))).)))..})}})..,.,)}})))),}}))))......)))))..,{{||||,.}}},...},}},,}.......}
Forensic Context

No forensic context available.