Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0004700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0088
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
6:34956641-35021942 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:34988864-35054165 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-396.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -417.95 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 321.48
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((...(((((..(((.(((((...)))))..))))))))...))))).........((.(((((((.....(.((((..((......))..)))).).(((((..((.(((((((((..........(((.....((((.((((...)))).))))...)))...((((((((.........((((((....))))))..(..((((.((((...((((((...............))))))))))))))..)............(((((.(((((..(((((.......((.....)).........(((.(((......))))))......((((((((((((((((((((((.((((............))))..)))..((....)).....))))))))))))......)))))))((((((..((......))..))))))...((.((.((((((((.(....).)))))))))).)))))))))))))))))...((((((.......((((((....))))))...........(((((.((..((..........)).)).))))).(((((.((((.((((((.((((((.(.((.(((.((((((((.(((..((.(((((..(((.....)))..))))))))))...)))))))).))).)).)..)))(((......)))..))).)))))))))).)))))(((....)))..((....))(((((.(((((.(.(.((..(((....)))..)).).).))))).)).)))))))))))))))))((((.((......))))))...))))))))).))..)))))((((((..(((...)))...))))))........((((.......(((((......(((((((.(((((((.(((.....))).)))))))(((.((((((.((((((.((((..(((..(((((((....................(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..)))((((.((((..(((....)).)..))))))))....)))))))(((.(((((........)))))))).........(((((((((..(.(((((.((....((((((((..((((.....))))....)))))))))).))))))..))))))))))))))..))))))))))).))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((..,{{(({.,{{{{{(({{({,..||.{{||||||,}...|||,}....}|}..||,|||||||.....{.((({..{{......)),,)))).).,{(((,.((.(((((((((..........{({{(((.((((.((((...)))).)))).)))))...((((((((.....{{{{((((({....}))))),.|}}|((({(((,...((((((.,{........,},.))))))||||||||..,.,,,,.{,{{{{(((((.((((,..((((,.....,.{({,...}}.........{,,.{{{....,{||||,,..,,,,{.,,,|||||{{||||||{(((.((((............))))..)))..||,..,))}}...)))),))))))),.......,}}}},...|||,.}}}}}}}}|...{((((..((({({.{(((((({.|....}.})))))))}}.},)))),.)))))..,{{.{(((((({{.,,..((((((....))))))...,.....,}|,|||}||.}||}}}}},....,..,}.}}}}}.{((((.((((.((((((.((((((.(.((.(((.((((((((.((,.(((.(((((..((({...,)))..)))))))))}...)))))))).))).)).)..))}(((,.....)))..))).)))))))))).))))|(((....))),.((....))(((,(,(((((.(.(.((..(((....)))..)).).).))))).)).)))})))}}))))))))((((.((......))))))...))))))))).))..,))))((((((..(((...)))...))))))........((((.{{....{{{{,..,,,,(((((({.(((((((.(({.....})).))))))){({.((((((.((((((.((((..(((..(((((((.........}..........(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..)|}{(((.((((..{((....)).}..))))))))})),)))))))(((.{((((.,,...,.))))))))....,,,,{(((((((((..{,(((((.((....((((((((..({((,,...}}))....)))))))))).))))))..))))))))))}))),.))))}}}}}}),)),,
Forensic Context

No forensic context available.