Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0005400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0099
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
6:34962079-35028030 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:34994302-35060253 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-337.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -353.58 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 252.85
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(..(((((((((((.(....).)))))))....)))).)(((((((..(((.(((((((((.((..((((((....))))))...))....))).)))))).((((................)))).(((((.((((.((((((.((((((.(.((.(((.((((((((.(((..((.(((((..(((.....)))..))))))))))...)))))))).))).)).)..)))(((......)))..))).)))))))))).)))))...(((((((((.(((((..(((((.(((((.(.(.((..(((....)))..)).).).))))).)).)))..))......((((((.((..(((...((((((((((.((((((.(((.......((((((..(((...)))...))))))........((((.......(((((......(((((((.(((((((.(((.....))).)))))))(((.((((((.((((((.((((..(((..(((((((....................(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..)))((((.((((..(((....)).)..))))))))....)))))))(((.(((((........)))))))).........(((((((((..(.(((((.((....((((((((..((((.....))))....)))))))))).))))))..))))))))))))))..)))).......))).)))))).)).)))))).)).)))..)).)))))).((((.((((.....)))).)))).......(((((...)))))))).))))))))).....)))..)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(..(((((((((((.{....}.})))))),...}))).)(((((((..(((.{((((((((.{,..((((((....))))))...,,....})).)))))},((,..({......)}....)))}|.(((((.((((.((((((.((((((.(.((.(((.((((((((.((,.(((.(((((..((({...,)))..)))))))))}...)))))))).))).)).)..)))(((......)))..))).)))))))))).)))))|{.(((((((((.(((,.{{((,{({{,,,,.|}|.||}}(((....)))..||,|{|.|||||,||.,.||||,||....})|}}})|..)))},{{(((((((((,{((,,,})),))....{.((((((..(((...}))...)))))),.....((((((((,...{(((((.((((((,(((.,.((((,{({(((,.{{,|||,||||}}}(((.((((((.((((((.((((..(((..(((((((.........}..........(((((........))))).)).))))))))..)))).)))))).))))))..))},(((.{(({..|{{,.,,)).},,})))}})|}}},}}}}|}|(({{((({(,{.,.,,.}}||||||....{{{{.{{,,||||,..|||||{|.||,.,.||||||||}}|,{((({,...||.{,.|||||,}}||{||||||..,,,)))))))}}))}}).,)}},...})))}}||},..})}}))))))))))))).))))))))))))))..|,..,,))))))}}}}}.}}}}}.,((({...)))))))).))))))))).....)))..)))))))
Forensic Context

No forensic context available.