Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0009800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038100 hsa_circABCC1_038
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16130329-16196574 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16036472-16102717 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-791.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -827.07 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 448.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.(((((((((((((......))))))....))))))))))(((((((((((......((((((((((.(.......).))))(((((((((((..(...((......))...)..)))))))).)))..((((((......))))))....)))))))))))).((((...(((((((.(..(((.....(((((((...((((((((((((.((((((((...))))......(((((..(((.((...))))))))))..(((((.((....)).)))))..))))))))))))))))..((((........))))))))))).....)))..).))))...))).)))).......(((((((.......((((((.....))))))(((((..........))))).........((.(((.(((((((((((((((.(((((((((((((..((((((...)))))).....((((((...((((.(((.(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).............))))...)))))).((((..(((.(((........(((((......)))))........)))))).)))).....((((((..((((((.(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))...))))))...))))))...((((..(((((((.........))))))).))))....)))))))))((((......)))).((...(((...(((((..(((.(.(((((.(((((((........))((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((((.(((..((.((((((((((.(((..((...((((((((((((((((.((((((..((((((..((..((((((((......)))))....(((((......)))))((((........))))...)))..)).)))))).........((((((((((...........))))(((.((((((..((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..)))......))))))..))))))))))))))))))).)))((((((...(((.(((.....((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((....(((((...((.(((((....))))).)).))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).))))))))).))))))))))))))))))......))..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))...(((.((....)))))(((((((((.(((.((((...((((((.......((((((...(((((((....(((.(((....))))))(((..(((((((........))))).))..)))..)))))))..)))))).(((((......))))))))).))..(((....))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).....((((((.(((...((.((.....)).))...))))))))).)))).))).)))).)))))))))).))).)).)..)))..))))))))...)).....)))).)).)))))))))))))))).)).))))))).)))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.(((((((((((((......))))))....))))))))))((((({{{{,,......((((((((((.(.......).))))(((((((((((..,...((......))...}..)))))))).)))..((((((......))))))....})))}}.|||||,{(((...((({,{{((,,{,{{,..,{{{({{((..((((((((((((.((((({((...}},,,,....(((((,(({(.{{...,)))})))))..{((((.({....}).))))).}))))))))))))))))..}},|}},,,,..,))}|}}})}}..,,}))}}.},)))),,|)}},}}}},}},,..(((((((.......((((((.....))))))(((((......,,..))))).........((.(((.(((((((((((((((.((((,{{{{{{....||{|||||.||||,|((((,((((((.,.((((.,((,(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)).,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))).|||((((((......)))))),,.,.....}},.))))...)))))){(((({.{{.{(((,...,.,.{({{(,,,...}|||},,......)))))).)}}),},..{{|}}}...}||||.(((((((..(((((((({,........)))))))))..))))))).,,}}.|||{,{|||||.,,.....}}|||,{||}}.,}}}}.)))))).(((((.((((((.((((((((((......((((((((((.....,,((((((((.((((((((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((({{(((..((.((((((((((,(((..,,...{(((((((((((((((.((((((.,{(((((,.,({.{{{(((({......)))))....{((((......))))}((((........)))).,,|}||.,|.}||}|||...,,,,,|{|{{||{||...........}))}{{{.((((({.,((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..||||,.....}}}}),.))))))))))))))))))).))}((((((.(((({.,,,.,}},((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((((({(((((,{,((.(((((,.,.})))}.}),))))).,{(((((((,,.,,...{{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{,{..,,,,})))),))))))))))))))))}))),,))))))......}}..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))..,(((((...((({,((((....)))).}..}))...))))).,......))).))))}((((({,(((({{((.,..,(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))),.},...,}}.).))))).,)))))))...{{{..,,|||.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))).{{{{.{{{...(((((((...)))))))..,,,)))))))|||||.{{{|}|||.{{((((((...{{,.,{{,......,.)))))}))}))))}))),})}).))))))))))))))))..)))))))))))))))..{|...))...,)),,...)))).)).)))))))))))))))).)).))))))).)))))
Forensic Context

No forensic context available.