Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0006100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0048
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:34984161-34984909 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:35016384-35017132 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-205.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -220.85 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 299.15
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(((.(((...........))).))).((((....((((((((.(((((((((((....)).)))))).............((((((((((.((((.((((((((....((((.(((((((((.(((((...........(((((((((((((.(((((..((.(((((((((........)))))).)))))..))))).)))))......((.(((..(.((((((((((..........)))))))).)).)..))))).((((((....))))))...)))))))).((((((((((..(((.((((......))))..))).))))))).)))((((((.((.(((.(((((((...(((.....)))...))).))))((((((((((((((((((((((((..(((((...((((..((((.((((..((..(..((((........))))...)..)).)))).).))).....))))...)))))((((..((((((((((....)))))...)))))...))))((((((...))))))))))))))))))))))))))))))))).)))))))).(((((((.....((((((.....))))))........))))))).....(((((((.......)).))))).(((((((....))))))))))))....))))))))).))))))))).)))))))...)))))....)))))))))))))))).....))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
.(((.(((...........))).))).((((.,..((((((((.(({({(,{{{{.,,,)),}}}|||,{,....,,,,,,((((((...({(.....,|}|,}))))}{(({.{,{|||{,({((((({{{.{((((...||||}}||||...,,,,...,}}}}|,{(((((({{(,,...{({({{.{({.,||||{{|||||...,},}|}}|||.|,{(((((((((.,....,,..}}}})))).}},},,,}}}|,{{,((({{{{|||}||....,,,,.|,.((((((((((..(((.((((......))))..))).))))))}.}}},{|{||}}|}||||||||,{,,,,(((,,,..}||,,.}}}.}|||((((((((((((((((((((((((..{,,,..{{((((.((.(((..,,.}}}.}}.}|,||}}......|||(({.,,,,,.}}))}}})|,,||,.||||...,,,,,||||..||||{|((((....})))),||||}||.,.,}}|{||{||,..)))))))))))))))))))))))))))))))}},.,)})))}.(((((((,..,.((((((.,,.,}}}}}}......,.)))}))),....(((({,{,{.....}},))))),(((((((....)))))))})|)},.,.},))))))).,,,},}}))))))).))}.))))))))},)))))))}}))))))).....))))
Forensic Context

No forensic context available.