Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0009900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038101 hsa_circABCC1_039
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16130329-16205439 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16036472-16111582 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-919.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -959.86 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 683.18
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
..(((.(((((((((((.((((((((...((((((((((.(((((.(((.((((....))))(((.((((.(.......).)))))))((((((((..(...((......))...)..)))))))).((((.((((((......))))))....)))))))))).))))))))((((......).)))..((((.((((((((..(((((((((((((.((((((.(((.(((((((((.(((((..(((...((((.(((((..(((((.((....)).)))))(.((((((((((((.......((((((((((..((((........((((.((((((.....((((.((.((((((..(((((((.......((((((.....))))))(((((..........))))).........((.(((.(((((((((((((((.(((((((((((((..((((((...)))))).....((((((...((((.(((.(((((((((((..((((((((((((((((((.(((...))).))))))))))))..((((((((((((((.((((((((......)))).)))).))........((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....))))).............))))))))).)))((((..((.....))..)).))))))))..))))))))))).)))((((((......)))))).............))))...)))))).((((..(((.(((........(((((......)))))........)))))).)))).....((((((..((((((.(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))...))))))...))))))...((((..(((((((.........))))))).))))....)))))))))((((......)))).((...(((...(((((..(((.(.(((((.(((((((........))((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((((.(((..((.((((((((((.(((..((...((((((((((((((((.((((((..((((((..((..((((((((......)))))....(((((......)))))((((........))))...)))..)).)))))).........((((((((((...........))))(((.((((((..((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..)))......))))))..))))))))))))))))))).)))((((((...(((.(((.....((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((....(((((...((.(((((....))))).)).))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).))))))))).))))))))))))))))))......))..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))...(((.((....)))))(((((((((.(((.((((...((((((.......((((((...(((((((....(((.(((....))))))(((..(((((((........))))).))..)))..)))))))..)))))).(((((......))))))))).))..(((....))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).....((((((.(((...((.((.....)).))...))))))))).)))).))).)))).)))))))))).))).)).)..)))..))))))))...)).....)))).)).)))))))))))))))).)).)))))))...))))....)).)).))))...((((......)))))))))).))))........((((.(.(((....))).)...)))).))))..))))))))))....)))))....))).)))).)......))))).))))....)))..))))).)))....)))))).......))).)))))).)))))))))))))..)).)))))).))))..((((((....)))))))))).))))))............((((((((....(((.((((....)))))))....(((((..(.......)...)))))))))))))......)))))))))))))..)))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
..(((.(((((((((((.((((((((,..{((,((((((.((({{.{{({((((....,}})|((,((((.(.......).))))|||((((((((..,...((......))...,..)))))))).|||.,((((((,,,...|}}}}}....||||}}}))),}}}}|}}}.{||,...,.{{{|{{{{{{(.((({((,,,,(((((((((({((,((((({.{{{,{{{{{{{((,(((((,,{((...,|||||||||,.{((((.({....}).))))),|}|||}}}|}}||||||.,||{|||{{|{{..{{{(,,,...,.{{{|,||{{(({,...((((((({{.,,,...,||})),.......((((((.....))))))}||||.,|,,.||||}}}}}.,.,,,.,,||,{||}|||{{{{||||||{|,{{{{,(((({{....{{{{{{|,.||||}|,,{,.{{{{{{,,,((((.{((,(((((((((((..((((({((((((((((((.(((...))).)))))))))))),.{{{.(((((((((,..,((,,(({{{{..||||{||,,...........((((((((((........)))))))))){((((((.((.(((....))))).))))))}.......(((((.....))))),}}},.}}..}}}))),,)),,.|||{{....||},.))))))))),)))))))..))))))))))).}|}((((((......)))))),},}},,,.,,,.}}}}...}}}))}{{{(({,(({((((...,{...,{,{(..,..,|||||{.......|)})}}.|||)|,.,{{{{,,,...)))}}.(((((((..(((((((({,........)))))))))..))))))){||||{({{(.,{{|({{{.....{||{{|{{{{|,,|,,||,||}}}}.(((((.((((((.((((((((((......((((((((((.....,,((((((((.((((((((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((({{(((..((.((((((((((,(((..,,...{(((((((((((((((.((((((.,{(((((,.,({.{{{{{{{{...,,,)))))....{((((......))))}((((........)))).,,|}||.,|.}||}|||...,,},,|{|{{||{||...........}))}{{{.((((({.,((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..||||,.....}}}}),.))))))))))))))))))).))}((((((,(((({.,,,.,}},((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((((({(((((,{,((.(((((,.,.})))}.}),))))).,{(((((((,,.,,...,{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{{{..,,,,})))),))))))))))))))))}))}},))))))......}}..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))..,(((((...((({,((((....)))).}..}))...))))).,......))).))))}((((({,(((({{((.,..,(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))),.},...,}}.).))))).,)))))))...{{{..,,|||.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))).{{{{.{{{...(((((((...)))))))..,,,)))))))|||||.{{{|,|||.{{((((((...{{,.,{{,......,.)))))}))})))}}))),})}}.))))))))))))))))..)))))))))))))))..||...}}...,}}....,)))}.)).))))})))))}}||||{}}..,,..))}},|||,},}})).})))))}}}}||||,,...,)))))))))),)}}),.......{{{{.,.(((....))).}...))}},}}))..}}}}||{{,|,.,.|||}}||,||||}||{{,....|||.||||||}||.||||}}.,)))}),})),.,,)})}))...}}..}}),)))))}.))))))))))))),,)),))}))),)))),,||{{||...,)))}}|||||.||||||..,{,.....,}|{{||||{..,}|||{((((,...}})))))...,|||||,.{{,.....}...})))))))))}))......)))))))))))))..)))....
Forensic Context

No forensic context available.