Basic Information
Symbol
hsa_chr6_0469700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0082
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:34990244-34990872
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:35022467-35023095
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-152.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-164.26 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
125.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.......)(...........(((((...(((((..(((...........))))))))..)))))((((.((((.((....((((((.........)))))))).)))).))))..((((((...(((((..........)))))..)))))).((((.......)))).((((((...((((((((....(((..((.((((((((((((.((((((.(((((((..((((((((.(((((((...((.(.((((.(((((((.........................))).)))))))))))....))))))).)...((..((.(((.((((..(((((((((...(((((.(((((.......))))))))))...)))))))))........................)))).))).))..))))))))).....))))))).))))))..(((((....)))))......(((.......))).....((((.....)))))))))))))))))).))).)))))))).))))))...((((..((((.....((((((((..........)))).)))).....))))..)))).(((((((........)))).)))...)
Thermodynamic Ensemble Prediction
(,......}{..{{{......(((((...(((((..(((...........))))))))..))))){,||.,,||.{|,,..((((((.........))))))|},|,||(((||,.((((((...(((((..........)))))..)))))).,,.)))}}.|||.,..((((({...((((((((....(((..((.(((((((((((({((((((.((((((({.(((((({{.(((((((...{{,(.((({.(((((({....................,,...})).))))})))}))....))))))).},,,{,,,{{.{{,,((({{,(((((((((.{,(((((.(((((.......)))))))))).,,)))))))))......,.,,.,,,}.}},.,,..,,,..}},,}}.,}})))))))...,,})))))).))))))..(((((....))))),,,|..{((.......)}}......,{{.....}}}))))))))))))))).))).)))))))),))))}}...|||{..((((,{...((((((((..........)))).)))).,}},))}}..}})}.(((((((........)))).)))...)
Forensic Context
No forensic context available.