Basic Information

Symbol
hsa_ANKS1A_0007100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0063
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
6:34991279-34992216 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:35023502-35024439 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-217.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -236.02 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 273.36
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
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Thermodynamic Ensemble Prediction
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Forensic Context

No forensic context available.