Basic Information

Symbol
hsa_chr6_0470800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ANKS1A_0045
Host gene
ANKS1A
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
6:35038915-35039443 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
6:35071138-35071666 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-144.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -155.55 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 120.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(.(((((.....))))).)........(((..((((((.((((((((....))).((((.((.(((((........)))))..........((((((.....))))))..))))))((((((((((.........)))))).))))...(((((((.(((((((......(((......))))))))...........((((((.(((...(.(((...))))))))))))).......(((((((.(((((..((((.((....((((...(((((.((((((...((((..(((...((((((((.(((..................))).))))))))...)))..))))....)))..((((((((((((.......(((((....))))))))))(((((..(((.......)))..)))))..)))))))..))).))))))))))).))))..))))))))...))))))..)))))))..((((((....)).)))).)))))))))))..)))...
Thermodynamic Ensemble Prediction
....{.(((((.....))))).,........{{{..((((((.((((((((....)))..,(({,(,(((({...,,...,)))).}})....{.{{((((.....))))))}.}}},.{((((((((((..,......)))))).))))}..(((((((.{,(((((......({{......))})))))...........{{{{{{.(((..,({(((,.{||||||,}|||||....,,.|||,,||},(((({{,{((,,,..}}|,,|}}}||{((,((,({{.,.((((..(((...((((((((.{{{..................})}.))))))))...)))..))))...,||}..(((((((((((({.{{,...,,,,...,}))})))))}(((((..(({.......)))..)))))..)))))))..,}}.))}}},,,})).})}),,))})))),}}})))))),.)))))))..{(((((....)),,))).)))))))))))..}}}...
Forensic Context

No forensic context available.