Basic Information

Symbol
hsa_APP_0008800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0115729 hsa_circAPP_013 hsa-APP_0055
Host gene
APP
Type of circRNA
Intron-Exon-Intron
Location (GRCh37)
21:27369675-27374847 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25997360-26002532 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-707.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -764.84 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 589.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((.((.((.(((((((((....)))).)))))((((((.(((((((..(((...((((((...((((((((((.((((((((.(((..(((..(((...(((((....))))).....((((((((.....((((((...((((.............(((((((..(((....))).....)))))))....((((((((......))).)))))......(((((...)))))..))))...)))))).......(((.........)))))))))))....))))))...))).)))))).)).))))......(((.....))).(((((((....))).)))).....))))))...)))))).((((....(((....)))....))))...)))..)))).))).))))))........(((((((...(((.(((((.(((((((.......((((......))))..(((((((...........)))))))....(((((.((((.((((((....((((.((((((.((..((.((.(((((((.....(((.........))).(((.((((.((((((((...)))))))))))))))((((.....)))).(((.((((((((((((((.((((((........)))))).((((((((((....(((.(((((.(((((......((((((..........)))))).....)))))(((((((((.(((((((((((((....((((((.(((...))))))).)))))))((.(((((..((((((((.(((...)))...))))))))....))))).))...(((((((((.....((((.....(((((((....).)))))).....)))).((((((....))))))..(((((...((((.....))))..)))))..)))))))))....))))))))......)))))))))(((....)))......))))).)))...............((((((((....((((......)))).))))))))...))))))))))(((((((...))))))).......)))))))))))..))).)))......((((.(.(((((.(((....)))))))).).))))((.((((.(((((........)))))...)))).))......))))))).)).))..)).))))))((((((((....))))))))........))))....)).)))))))).)))))........))))))))))))..)))...)))))))....(((((((((((((.((((((....((..(((.(((...((((((((((((((.(..(((((..(((............(((((..(((.(((((((........(((((((((((((.((((((....)).))))............................(((.((((.....)))).)))......((((((................))))))..(((((((((((((((((((....))))))).........(((.((((.....)))).)))..............(((((((((.....((((((.(((((.....))))).))))))...)))))))))(((((.((...............)).)))))........((((.....))))..((((((((((((((((((((.((.(((.((......)).)))))))))))))))))))))))))..))))))))))))((((.(((....))).))))..))).))))))))))))))))).)))...))))).))).)))))..).))))).)))))))))((..(((((((.......))))))).))...((((((((.(((((.((....(((((..((((((((....((((...((((........)))))))))))))))).((((((.((((((((.....)))))))).)))))).((((((((((....((((.....))))....))))))))))........)))))....)).(((((((((.....)))..)))))).((...)).......((((((((((..((((((((((......)))))..))))).))))..((((((....))))))......))))))........))))).))))))))...(((((...)))))......))).)))))..))))))(((((((..((....((.((((((......(((((.....((((.((..(((((((((......((((((....))))))......)))..)))))).))))))......(((.(.(((.((((((((..(((...........)))((((((((..((((.(.((((.....(((((((((((((........))).)))).))))..))......))))).))))..)))))))))))))))).))).)))).....)))))......))))))))))..)).)))))...))))...))))))))))).)).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((....{{((((((((((....)))).))))},|.|........,,|,.........,,{........))).}.)))))))(((....,{...((((((((.(((((((((......))))|((((...{{{,,.((((.(((((.{{,....,,,...(((((..(((....))}....})))){((((((((((((((((.,{{....(({{{{{{{..(((({...}}}}|{((((({,,|||||,.((((({(......((((((...(((.(((((((((((.(((.(((((((.(((((((,..((..,((((((((((((.{((((((...,||}.}}}|{({({{{{,{(,((((((((....})))))...(({.....))).{{{{{.{|.{{.{(((((.((.{(((((,((,.(((((((...(((.(((({{(((((((....,,.((({......})))..(((((((...........)))))))....{((((.((((.((((,,.,..,,||.((((((.((..((.((.(((((({.....(((.........))}{(((.((((.((((((({...}))))))))))))))|(({.....}))},(((.((((((((((((((.((((((........)))))).(((((((((({{,..,,.,,|||.(((((......((((({,,.....,..)))))).....)))))(((((((((.(((((((((((((,...({((((.(((...))))))).)))))))({.(((((.,((((((((.(({...}))...))))))))....))))).}}.,.(((((((((.....((((.....{{{{(((,,..,.}))))).....)))).((((({....})))))..(((((...((((.....))))..)))))..))))))))).}..))))))))......))))))))),.((({{.|.....,.))))).},,...............((((((({....((((......)))).})))))))...))))))))))(((((({...})))))).......)))))))))))..})).))).,....((((.{.((((,,(((....)))))))).}.))))|(,({{,.(((({........})))).,}}}))..,......})))))).)).))..)).))))))|(((((((,...|||||,,,.}}}}}}}))))}}}.,,.)))))))).)))))..,,,...))))))))))))..)))...)))))))...)).))))))})})))))).}}}|,,.))})}}}.))}))),))))},,.,|||.......)))))))))))).}}..)).}.}))))},).))))).)).))){((((((((.......((((((....)).))))....,........,,,.))))))))}.............((((((((((.((((((({.,{(((((({((({....,)))),)))))))))))))){((((((,...,))))))}.........(((.((((.....)))).)))..,,,.,,.,,,,.{{{{{{{{(...{|{{{{{,.{((({.....}))}|,||||}|,,.}}|||}}}|{{|||,|,,.|,.,}}}))}}..,,,},|||.{{{{((((((((((((((........)))))))))))))),}}}}.}}}.,,.,(((((({....(((({,|,{((((({.{{|{((((((,..{({,,,,....,},))}..,.))))))}(({({(((((.,...||,..||||.,,,},.,|||||...,))))),,}}|,,,,{{((((............))))))))).)))))))..))))))))))))|..........)))))))))).)))))))..........,,,,,..,,.{{(({{{(((,(.((((((((,.((((((((.....)))))))).),)))))))),.)))))))))))})),.)))).))).)))))),,.....,},..)))))....,,,,((((({(((.....)))..)))))).||....,,}}}}}))),.,.((({..((((((((((......))))}.,))))).))))..((((((....))))))..|{{|||||||,,.......,,|,,......((({.(((((...))))).}))){{((......))))))}))))))),,}},.}))),}))}}})))))))}((((((.{(,(........,)),)))))).....))))).))))(((({{{(,,.,....,)))))))).,,,.},}.)))),..(((.((((((((..(({...........)))((((((((..((((.,.((((....,,{(((((((((((........))).)))).)))).,}.......))))}.))))..)))))))))))))))).))){{{{|...))))).})))).))))))))..,,......(((((..(((......))).)))))...)))
Forensic Context

No forensic context available.