Basic Information
Symbol
hsa_APP_0009300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0061345
hsa_circAPP_009
Host gene
APP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:27372330-27423509
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:26000015-26051193
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-174.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-182.75 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
141.21
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((.(...((((....))))...).)))...))))))(((((((((.(((((((....))))))).))))))).......((((((((((((((((.............(((((((((((.(((.((((((((((.....)))........((((((((((.((...(((...((((....))))..))).........................((.((.....((((((...((((..........((((..(....((....((.((....)).))......))......)..))))........)))).....))))))........)).)).)).))))).)))))((((((.(..((((((...))))))..).))))))..((((....(((((.(.((..(((.......))).)).).)))))....))))..((((.(((((((.(((((..((((((........))).)))..))))).)))).))).))))...........))))).))))).))))).))))))))))).))).))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((.(...((((....))))...).)))...))))))(((((((((.(((((((....))))))).))))))).......((((((((((((((((..............,{{{{,{(((((,...}}}}}|(((.....|}},,.,|||{((((((((((.((...({(...((((....))))..}))....{......||.....,..|...((.{,.....((((((...((((..........((((..{..{.{(....{(.{{....}).))..,..,}}.........))))........)))).....))))))........)),)).)).))))).)))))|(((((.{..((((((...))))))..,.)))))}..{{(({...{((((.|.{{..(((.......))).)}.}.)))))....))))},{||({((((((..((((,..(((({{....,{{{|||{|||{.,,,,..,))).)))}.)))}.,},...,..))))).))))..)))))})))),}))))).))).))))))))))
Forensic Context
No forensic context available.