Basic Information
Symbol
hsa_APP_0012700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0061350
hsa_circAPP_001
Host gene
APP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:27462259-27543138
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:26089943-26170820
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-232.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-241.06 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
105.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((...((((((..(((((((..((.((......)))).)).)))))...)))))))))((.((((((((((((.((..((((((......))))))((((((((.(((((.(.((((((((((((((.((((..(.......)..)))).))....)))).))).).))..))).))))).))))).))).((((.((...)).))))(((((.((((((((..(((.((((.((.(....((.(.((..((((((((...(((((.(((((((((.((((((.((((((((.((((..((.((((..((((.((((..(((........)).)..)))))))))))).)).)))).)))))..))).))))........)).))))...))))).((..(((.(((((((((.......((....)).......)))))))(((((....))))).)).)))..))...)))))))).)))))..)).).))...)))))))))))))))))).)))))......(((...)))..)))))))))))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((...((((((..(((((((.,{(.((......}}}).)).)))))...)))))))))((.((((((((((((.(({.((({(,{{.{{,},}|||((((((((.(((((.(.{{(({(((((((((.((((..(.......)..)))).))....)))).))).}.))..}}).))))).)))))}))),((((.((...)).))))(((({.((((((((..(((.((((.((,(....((.(.((..((((((((...(((((.(((({(((({((((({.((((((((.((((..((.(((,.{((((.((((..{((........)}.}..)))))))))))).)).)))).)))))..))}.||||........}},)})).},},))}.||..|||.|,(((((((...,...{{....}}.....,.))))))),{{((,...})))).}}.))).,)),..)))))))).)))))..)).).))...)))))))))))))))))).}))))..,}}}|.|..})),.))))))))))))))).))
Forensic Context
No forensic context available.