Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0012000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038109 hsa_circABCC1_047
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16141999-16205439 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16048142-16111582 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-708.30 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -740.43 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 484.70
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....((((((.......(((((...((..((((((..(((((((.............((((((((((........))))))))))(((((((.((.(((....))))).))))))).......(((((.....)))))))))).))..))))))..)).)))))(((((((.((....)).)))).)))))))))((((.((((.(...((((((......))))))).)))).)))).((.(((..((.((((..(((((((((((..((((.....((..(..(((((((.......((((((((((((..(((((......))))).(((((((..(((((((((.........)))))))))..)))))))((((((((((..((.((((.....(((((..((((.((..(((((..((.(((((.((((((.((((((((((......((((((((((.....(((((.((((.((((((((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((((.(((..((.((((((((((.(((..((...((((((((((((((((.((((((..((((((..((..((((((((......)))))....(((((......)))))((((........))))...)))..)).)))))).........((((((((((...........))))(((.((((((..((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..)))......))))))..))))))))))))))))))).)))((((((...(((.(((.....((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((....(((((...((.(((((....))))).)).))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).))))))))).))))))))))))))))))......))..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))...(((((...(((..((((....))))....)))...)))))........))).)))))((((((.((((((((.....(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).))))))).......)).).)))))..)))))))...(((....))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).((((((((...................)))))))).))))))))).....))))))))))))))))..)))))))))))))))..))..............)))))..)).)))).)))))..(((((........)))))....))))))..))))))))))))))))..)))))))))))))..)..))...........(((....))).....(((((((........(((((((...(((..(((((...((((..((.(((.((((((.((.((((...)))).)).))).))).).))...))..)))))))))..)))...)))))))))))))).)))).)))))))))))...)))).))...)))))((((.(((.......((((((((....(((.((((....)))))))....(((((..(.......)...))))))))))))).....)))))))..))))..........
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,((((({(,,.,,..,||||||||..,{(({{((,,,,..||||,|}}}...........||(((((((,{{{{{{.{||||||||||.((((((.((.({{...,,||||.}}||||{,......((({(.....}||||{||,..,,{{.|||||{{,,{{{{({(((.{{({{{....}},)))).))),||..(((((.((((.{,,.((((((......))))))),)))).)))))..}|.,.,}}}||||,}||||{||||||}}|,||...,,{{,,{..{{({{|{.,.....{{{{{|,{{{||,.(((((......))))).|{|{(((|.(((((({,|,..,.....}))))))))}.}}|)))|((((((((((..((.((((.....(((((,{{(((.({..{((((.,|{.(((((.((((((.((((((((((......((((((((((.....,,((((((((.((((((((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((({{(((..((.((((((((((,(((..,,...{(((((((((((((((.((((((.,{(((((,.,({.{{{(((({......)))))....{((((......))))}((((........)))).,,|}||.,|.}||}|||...,,,,,|{|{{||{||...........}))}{{{.((((({.,((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..||||,.....}}}}),.))))))))))))))))))).))}((((((.(((({.,,,.,}},((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((((({(((((,{,((.(((((,.,.})))}.}),))))).,{(((((((,,.,,...{{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{,{..,,,,})))),))))))))))))))))}))},,))))))......}}..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))..,(((((...((({,((((....)))).}..)))...))))).,......))).))))}(((((,,(((({{((.,..,(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))),.},...,}}.).))))).,)))))))...{{{..,,|||.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))),{{{|.{{{...(((((((...)))))))..,,,)))})))|||||.{{{|,|||.({((((((...{{,.,{{,......}.)))))}))})))},))),})}}.))))))))))))))))..)))))))))))))))..||...||...,,....}}})).,)),)})}.)))})..(((((........)))))....))))))..))))))))))))))}|.,||||||},|||||.,|..}},,....||,,,(((....})).{,..(((((((.....,,{(((({((...(((..(((((({.,{((..{,.({(.((((((.((.((((...)))).)).))).))).).))...}}..}})))))))..)))}}.)))))))))))))).)))}.}}}))}}})))...,}})})),}}|,)))|||||||{..,,...((((((((....(((,((((....)))))))....(((((..{,......}...)))))))))))))}}})}))))))))}))))..}}}}},,)
Forensic Context

No forensic context available.