Basic Information
Symbol
hsa_APP_0000700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0079
Host gene
APP
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
21:27258568-27261142
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25886256-25888830
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-765.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-816.32 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
608.63
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
......(((((.((..(((((((((((((((.(((...((((........(((((((((((..(((((....((((..((((.((((.((((((((((((((((.(((((....)))))..)).....)))))))).....)))))))))))))).(((((((((((((((((((.((((((((.((((....)))).)))).)))).)))))))).))).((((.((((((.((((.(((((((.....)))))))))))..........(((((((((((((((....((((((...(((......))).....((((.((.((...((((..((((.((((((((((((((((...((((((((((.((((...))))..))))))..(((((((((...(((.(.((......)).))))...))).))))))...........)))).))).))))))...)))...)))).))))..))))...)).))))))((((((((...)))).))))(((((((((..((((....((((......)))).(((((.(((((((...............(((....)))(((((.....((.(((((...(((((((....)))))))((..((((.(((......))).))))...)).))))).))((((((((((((((((((((....(((((((.(...((((......))))...).)))...))))....)))))))).....(((((((.((.....)).))))))).....(((((...)))))....)))))))))))))))))..........)))))))))))).......))))..)))))))))......))))))........)))))))))))))))(((((.(((((((((....(((((...)))))(((....))).....))))))).)).((((((...))))))(((((.((........))...))))).....)))))..(((.((((((...........))))))...)))........))))))))))...........((((((((...)))))))).............((((........)))))))))))))))).....)))))..)))))))))))..(((((((((.((((((..((((((.((((.((.((((.((((((((.....)))))))))))).))...)))))))))))))))))))))))))....))))....))).))))))..)))))))))..))(((((((((((((..((((((((((((((.......(((((......((((((.(((..........(((....)))))).))))))...((((((((....((((((((...((((.((((((....)))))).))))(((((((.....)))))))...((..((((((....(((((((.....((((((((((((((((((((((......(((((.(((.....(((((....))))).))).)))))......)))))))..)))))..((((...((..(((((...(((...))).))))).))..))))(((((((((...(((((((.....((((((((((((.((....)).)))).(((((.......))))).....))))...)))).(((.((((((((((((((((......)))))))))))))))).))))))))))...(((((((..(((...((((((((((((.....((((...((((...(((......(((((((((((((..(((....((((((((((.((....)).))))))))))...)))..)))))).(((((((.((((.....)))).)))))))(((((....)))))..........(((.((....)).))).........((((.....))))....)))))))....((((......)))))))...).)))....))))...)))))))))))))))..)))))))........)))))))))..)))))))))).......))))))).....))))))..))............(((..(((((...((.....)).....))))).....))))))))))))))))))))))))..((((........))))(((((.(((...((((...((((((........)))))))))))))))))).....(((((..(((((((((....................((((...(.(((((((.((((........))))))))).)).).)))))))))))).)..)))))...(((((((...(((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))))))(((((.......)))))..))))))))))))))....)))))))))))))(((....)))............(((..((((((..((((((.((....)).))))))((((.(((..(((((......)))))..))).))))...............)))))))))...)))))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
......(((((.{{..(((((((((((((((.(((.{{{......,,,{,(((((((((((..(((((....((({..{(((.((((.((((((((((((((((.(((((....)))))..)).....)))))))),....}))))))))))))}.(((((((({((((((((((.(((({(((.((((....)))).}))).)))).))))}|||.|||.{{{|,{|||||.(((,{(((((((.....))))))))))).,...,,,..((((((((((((((({{..((((((...,,,......,}}.,,..{(((.((.((.,.((((..((((.((((((((((((((((...((({((((((.((((...))))..)))))),|{((({((((...(((.{.{{......)).))})...)||,|}}}}|,,....||,,.,,,),))).))))))...)))...)))).))))..)))).}.)).))))))|{((((((...)))).))}|(((((((((..((((....((((......)))).(((((.(((((((...............,,,....}||((({{{.......,{{{,..,(((((((....)))))))|{.,((((.{({......}}}.}}||,,..,.}}}},.,,{{{(({{{{{{,((((((((....(((((((.{...((((......))))...,.)))...))))....)))))))).....(((((((.((.....)).)))))))....{,{{((,,.)))})}}..}}))))))))))))))),....,,...)))))))))))).......))))..))))))))),.....))))))..,},...}))))))))))))))|,,||,,.((({(((.,{,{{{{,...}))|}{{,...,))),.,..}}))))},}},|(((((...}}})}|(((((.{{........))...))))),....}}|||..(((.(((((({.........,))))))...)})........})))))))}|,.......,|.((((((({...}))))))).,...........((({,({...}}))))))))))))}))).....)))))..))))))))))}..((((((((((((((((..(((((((((((.{{.((((.((((((((.....)))))))))))).}}...)))))))))))))))))))))))))..,}}}},,})}))).))))))..)))))))))..}|(((((((((((((.,{(((((((((((((....,,,(((((.....|{(,{((,(((..........(((,,,,||||||{|||,,,}}}|(((,(((...}|||||((({,,(({{.|((({{....}))))).))))|((((({....,))))))),,,.,|||,,,|,,,,..,.(((({{{{{((({({,{(({{{(({{{.,,{,..,,,{{{((.{||..,..(((((....))))).,}..))}}}..{,{{({|,,,}}})},,|((((((...((.((((....((((..(((((.,{(((,.,,,.,{|{,,,..,}}}.......}},)))))..)))).,............(((..((.(((((((((((.(({({((({...{,{|{{.(((.((((((((((((((((......)))))))))))))))).)))})))}.....(((((((..(({..,((((((((((((.....((((...{(({...(((......{((((({((((((..(((.,,.((((((((((.((....)).)))))))))).,,)))..)))))).(((((((.((((.....)))).)))))))(((((....)))))........,,({{,{({,..}}{|||.|||||...,{{{.,,,,)}}),,,.}))))))..,.((((......)))})))...).})),...))))...)))))))))))))))..))))))){{{...........))).))))))))))))),....))))).)).))))))).)).))))))}.......|||..{{{{{...|{.....||.....)))))...}}}||))}}}))}))}}}}}.}}}},...,,{,}}}})))))))|{{{.{(((,{{{(,.,,{(((({({{{.,,,.}}}}}})))}))))))))..,,.|||((..|{{{{|{{(....................((((...(.(((((((.((((,,....}.))))))))).)).).)))))))))))).}..})))}|,.(((((((...(((((..(((((((.((.........)))))))))))))).)))))))(((((.......)))))...}))))))))))))....))))))))))))}(((.,..}}}...,}}.,,,..||{..{(((((..((((((.,,....},.))))))((((.(((..(((((......)))))..))).))))..........},...))))))}}}...))))).}
Forensic Context
No forensic context available.