Basic Information
Symbol
hsa_APP_0003400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0123
Host gene
APP
Type of circRNA
Intron-Intron
Location (GRCh37)
21:27307042-27307895
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25934728-25935581
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-222.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-239.59 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
202.96
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((......)))))((.(((..((..........(((((.((((((((((((((.((((....)))))))))))).)))))).........((((((((((.((((((...............))))))))))))))))((((.....)))).....((((((............((((.......))))................((((.(((((((...(((((..........((((((..((((((((..(((.(...((..((((((..((((....((((.((....)).)))).....))))..))))))..)).)))))))))).))..))).)))((((((((((....(((((((((..((((((.(....))))))).(((((((((((((((....)))))).(((((((...)))))))..)))))))))....((((........))))............))))))))).))))).))))).....)))))...))))))).)))).)))))).((((.(((((((......(((((....((((.((((((((((.(((((((.....)))))))((((((((((............((((((..((....))...))))))..)))).....))))))....(((.....)))..)))))))))).)))).....)))))......))))))).))))((.((((((.......)))))).)).....((((((.((((((((....(((.....(((((.......)))))...))).....))))))))..))))))((((.....)))))))))..........))))).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((......)))))((.(((..(({{,....,,,||,,{.((((((((((((((.((((....)))))))))))).)))))}{{{{{{{{{((((((((((.((((((............,..)))))})))))))))}((((.....)))).....((((,.......}}}}..|}}}}.}}}},..,,..............,,((((.(((((((...(((((,{{{,.....,,.|||,||{(((({({{(((.,..,||,,|{||||..((((..,.((((.{{....}}.}|||.,.,,}}}}..||||||..}}.,}}})))))),..,,....,}}((((((((((....(((((((((,,((((({,{....}},)})),||||{{{{{,{{(((,,.,||||||{(((((,,..})))))))}})),))))),.,..((((........)))).....,......})))))))).))))).))))).,,..}))))...})))))},))},.}},,,,.{(({.(((((((.||...(((((....{{{{.((((((((((.{((((((.....))))))}{((((({{({..{{{,......((((({.,({....))...))))))..},,,,}}}.)))))}...,(({.....}}),,)))))))))).)))).....)))))....||))))))).)))){{.((((((.......)))))).}).....{(((((.((((((((....{((.....(((((.......)))))...}}).....))))))))}.)))))}((((.....))))}}}}}||,......,},))).))
Forensic Context
No forensic context available.