Basic Information

Symbol
hsa_APP_0004600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0159
Host gene
APP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:27326904-27423509 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25954590-26051193 UCSC (hg38)
External Database
circbank

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-385.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -407.27 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 316.88
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.((((((((.............)).)))))).(.((..(((.((((((((((.(((((((....))))))).)))))))(((((((((.(((((((((.(((......))).)....)))).((((((....))))))(((.....)))....((((....))))...)))))))))))))..(((...(((((.((.(((............(((((...((((((...(((((((....(((...............(((.((((((((.(((.(((((.((((.(((((((.((((((.((((.................))))................((.((((((((((.((((((.(..((((((...))))))..).))))))((.((((.....)))))).....(((...)))((((((((..(((...........)))((((((((..((((.(.((((.....(((((((((((((........))).)))).))))..))......))))).))))..))))))))))))))))))).))))))).))..........(((((.....)))))...(((((..(((......))).))))).....)))))).((((.(((..(((.....))).))).)))).....)))))))...))))((((.(((........))).)))).((((......((((((((..(((((....)))))..)...........(((((..((....))...)))))..((((((....((.......))..))))))...((((((((........)))).))))..(((((........))))))))))))....))))((((((.........(((.(((.(((((((.....((.((((((.((((..(((((.....)))...))..)))))))))).)).....))...)))))))))))..))))))))))).))).)))))))))))(((((.(((((.......((.(((((.............))))).)).(((((..((...........))..)))))))))).))))).)))....)))))))....)))..)))...))))).((((......))))((((((((....)))))))).))))).))))))))(((.(..((.(((......)))))..))))..))).)))..)).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
.((((((((..,........,.))}}))))).{,{(,{((({((((((((((.(((((((....))))))).)))))))(((((((((.(((((((((.(((......))).|....}}}}.{(((((....)))))}(((.....)))....{||{|...))})),.)))})))))))))..(((...(((((.(,{(((.........,..(((((.,.((((((.{.(((((((....(((...........,{(.,((.{(((((((.(((.(((((.(((({((((((,,((({,{.((((..{,...,,,.}.....}))).,.,,,.,..{{{{{{((.{(((((((((.{(((((.{..((((((...))))))..,.)))))|{{.((((.....))))}},,...(((...}))((((((((..(((...........)))((((((((..((((.,,((((,...,,{(((((((((((........))).)))).)))).,},......)))),.))))..))))))))))))))))))).))))))}.||{.,.{{{{,..{(((.{{{{.||||...{{(((..(((,,...,|||,|}}||.....}}},,,.((((.(((..(((.....))).))).)))),,,.,,))))))...,,,|((((,(((.,......,}}.)}))}||||}}.,,,((,,,,,,.}||||{..,,}},))..),.,,,.,....|||{,}}||.}}})}}).)))))..{|||{{....{{..,,...,,..))))}}...(((({{{{...,,,.,||}|||}}}..(((((..,,,...}}}},))))))),,,.)))}||{|||..,....,.|||}.|}||||||.,.....((.((((((.((((..(((((.....)))...))..)))))))))).)).....}}.}})))))|}}))}..))))}}))))).))).)))))))}|||{|||,..(((((......({.(((((.,........,..))))).}).||,{{..||..,||||.,.,})},}))}}.}}})))}..},)))....)))))))}...)))..))),..))))).,|((,,....)))}((((((((....)))))))).))))).)))))))){{{.|,,||,|||......))|||..,,},,|)}).,}}..}}.}
Forensic Context

No forensic context available.