Basic Information
Symbol
hsa_APP_0005200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0012
Host gene
APP
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
21:27326904-27462388
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25954590-26090072
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-140.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-148.08 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
130.16
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((....((.(((((..........((((((....((......((((((...........))))))....))...)))))).))))).))))))((((((........(((.(((((.(((((((...(..((((((((((((((..((.((.(((((..(((((....(((..........))))))))))))).)))).))))).)))))))))..)...(((((...(((........)))..((((.((((.(((.((((((.(((.((....))))).))))(((((((.(((((((....))))))).))))))).....((((((((.....(((((......))))))))))))).......(((((((((....)))))))))))))))))).))))........))))).)))))))...))).)).)))))))).....)
Thermodynamic Ensemble Prediction
((((.,.,({.{((((,..,,,,...,|{|||.,..|||,,,..((((((...........)))))){,..||{,,|,}|||.}}}||,},}}}}{{{{{{.,,,.,,.{((.(((((.(((((((...{,.((((((((((((((..{(.((.(((((..(((((...,({{.,....,}).)}})))))))))).))}}.)))))})))))))))..}.,|((({{...(((.,......))).,((((,{{(,,{{{.{{((((.(((,{{.,..,,))),))}}(((((((.(((((((....))))))).))))))).....((((((({...,.({{({......)))}}}))))))).......(((((((((....)))))))))}})}))))}.}})}....,..,))))).)))))))...))).)).))))))})..,,,)
Forensic Context
No forensic context available.