Basic Information

Symbol
hsa_chr21_0027100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0127
Host gene
APP
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
21:27348296-27423395 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25975983-26051079 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-199.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -210.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 163.75
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((((.....)))).((..(((((((....(((((....((((..((((((((...(((((...(((.....)))..(((((.......)))))(((((..(((((.((....)).)))))..)))))((((.((((((.(((((((((((((((((.....)))).))))))))...........)))))))))))))))))))).)))))))).....)))).......)))))...((((..((.(((((.(((.((((((...........(.((((((.((.((((((((((((((..((((.(((...(((.((((......))))))).............)))..))))((((....(((((((((.((((.......))))))))..)))))....))))..((((((.((.((((((...)))))).)).)))))).)))))))))..))))).((........((((((.....((((((...............))))))........................(((......)))..................))))))........))............)).)))))).)...........)))))).))))))))..))..))))......(((......)))................)))))))...))..
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((({....}))).||..(((((((....(((((.{,.{....)}..})))}........,,,((((,,{{{||..(((((.......))))),{(((..{((((.{{....,,.}}))},{|}||{({,((((((((.((({,((((((((((((.....)))).)))))))).,,,.......,|||||||||,,,,,.)))),}))))}},.}))}))))...}}}}}))))...((((..((.(((((.(((.((((((...........(.((((((.((..,{(((((((((((..{{((.{,,...(((,((((......}})}}}}.{,.,{......})}}..)}))((({....(((((,{{(,((((.......)))}})),,.)))))....))))..((((((.((.((((((...)))))).)).)))))).)))))))))},{|||{.((........((((((.....{{((((......,,,,.....}.}}}}..................,.....{,,......))}..................))))))........)).,.},.......)).)))))).)...........)))))).))))))))..))..))))...}}}},|,.}}}}).,................)))))))...},..
Forensic Context

No forensic context available.