Basic Information

Symbol
hsa_chr21_0027400
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-APP_0077
Host gene
APP
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
21:27362191-27363347 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
21:25989877-25991033 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-224.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -246.53 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 279.43
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
...(((((((((...((((((((..((((.......))))((((((....(((((((.((((((....(((((...(((((........)))))....((((..(((((((....((((.((((((.(((((..................(((((..(((......................))).)))))...((((((((.((....((((...................)))).........(((((............))))))).))))))))........(((((((........((((((((......))))))))...((.(((((((((((((...................(((((((((((....)).)))).)))))....)))))))))))))))....))))))).)))))........)))))).))))..))))))).))))..)))))..)))))).))))))).........((((..((((((..(((((...............((((........))))...............)))))..).))))).)))).((((...)))).((((((....((((((((...(((((.((((....((.(((.((.((((.(((((((((....(((((((........((((((((.......(((..((...(((((.....)))))..))..)))............((((((.((((((.....))))))..))))))((((((((((....(((..(((((....))))).....(((....((((..............))))..)))(((....)))........)))....))))))))))....)))))))).((.....))......(((((....))))).............((((((((((((.((((((...((....)).))))))))))......))))))))))))).)).....))))))))).)))).)).)))))(((((...)))))....)))).))))).)))))))).)))))).........)))))).........(((((((....))))))).......))))))))...........(((((........)))))..)).))))))).....
Thermodynamic Ensemble Prediction
...(((((((((..,(({{{,,,..,,,{.......,|||{{{..,....,,,,,,(,(((({{....||||||..({{{{........}||},....{(((..(((((((....((((.((((((.,,....,......|{,...,}}.{{(((..,,,,,,,,{,...........,}}}))),)})))...{(({{{{{.{{,.,.{{{{...................}})}.....,,,.(((((............))))),),))}))}}}...,,...(((((({......,.{,(((((,....}})))}),}}|..((.(((((((((((((.........,,,...,...(((({({{{{{....)).)))).)))))....}))))))))))))))..,.})))))),)))||,....,},)))))).))))..))))))).))))..,}}}}..)))))).))))))),........,,{{,,{(((({..({{{(,,,,.......,,..{{{{........))))...............})))),.||}}}}),,,,,.((((...}})).{(((((....((((((((...(((((.((((....((.(((.((.((((.(((((((((....(((((((........((((((((,,,....((({,((...(((((.....)))))..}}..}}}.....,,,,,..((((((.((((((.....))))))..)))))),,((((((|({,..,{,..{{(((,.,{||||},,...(({,,,,({((....,,,,,,,.,.}))),,)))||||...,},,}}},,..,,,..,.}}}}}}}}}}}},.)))))))).{{.....}}......(((((....))))).............((((((((((.,(((((((...((....)).))))))).,,..,,,.})))))))))))).)}.....))))))))).)))).)}.)))}}(((({...}))))....)))).))))).)))))))),))))))...,,..,,,)))}},.,,,...,(((((((....)))))))}......},)))})),,}........{,,{,........})}}),,)),})))))).....
Forensic Context

No forensic context available.