Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0013700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038118 hsa_circABCC1_056
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16162013-16180848 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16068156-16086991 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-294.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -307.61 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 169.26
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(...)((((((((....))).(((.....)))((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((((.(((..((.((((((((((.(((..((...((((((((((((((((.((((((..((((((..((..((((((((......)))))....(((((......)))))((((........))))...)))..)).)))))).........((((((((((...........))))(((.((((((..((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..)))......))))))..))))))))))))))))))).)))((((((...(((.(((.....((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((....(((((...((.(((((....))))).)).))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).))))))))).))))))))))))))))))......))..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))...(((((...(((..((((....))))....)))...)))))........))).))))))......((((((((.....(.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(...)((((((((....})).(((.....)))((((((.(((.........((((.(.(((((((((..(((((((((((...(((({{(((..((.((((((((((,(((..,,...{(((((((((((((((.((((((.,{(((((,.,({.{{{(((({......)))))....{((((......))))}((((........)))).,,|}||.,|.|||}|||...,,,,,|{|{{||{||...........}))}{{{.((((({.,((((..((((..(((......)))))))...))))))))))..||||,.....}}}}),.))))))))))))))))))).))}((((((,(((({.,,,.,}},((((....((((((((.....)))))))).)))).....((((((((({(((((,{,((.(((((,,,.})))}.)),))))).,{(((((((,,.,,...,{{.{((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))}.}}|,{{{{..,,,,})))),))))))))))))))))}))}},))))))......}}..))).))))))))))..))..))))))))))))))))))).))))))))).)))))..,(((((...((({,((((....)))).}..)))...))))).,......))).)))))).....,({((((((.....{.(((.((.(((..(((((((........))))).))..))))).))).)))))))})))))))
Forensic Context

No forensic context available.