Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0001000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111278 hsa_circASTN1_023 hsa-ASTN1_0020
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176837980-176857340 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176868844-176888204 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-231.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -244.06 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 242.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....)(.((.((((.((..((((((((..(((((((..(((((.......)))...((((((((((((....(((....))).(((.((((((..(((((.....)).((((((..((.((((((((((.((.((.(((((((((((..((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((((....))))))).))))).....)))))))...............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))............))))).)).))))))))...........)))))...))))))..((((.((((.....((((((.((((....(((..((......(((.....))).....))))))))).))))))...)))))))).)).)).))))).))))).))....))))))((((.((....(((...((((.....))))...).))....)).)))).((((((..((((...(((........))).))))..)))))).))).)))))).))).......(((((..(((((..(((((((...............))).)))).))))))))))...))))).)))))))...........))))))))).))))))))..)).(((((((((.((...)).))).)))))).)))))).)
Thermodynamic Ensemble Prediction
{{{..,({(({((,,.(({{,((((((({{((({,{|,,|}||||||||..,,{{,,(({{{,{{{|{|||,,|,|,}}})),,,|,,.,})))|},}}||.....,,.,((((({.(({,((((((((({,,{(({(,(,(((,,,,..,,,,,,||||.|||||(((((((,(((((.(({{((((....))))))).))))).,...))))))){((((((({{{{...((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,..,}))),,..........|||||{||{{{|,,,,,{({{{{{{{{{|||||{..,|||||{,{(((.{{{(.....((((((.((((....(((..,,......(((.....)}}.....},))))))).))))))...}}}},,,.{|{{||{,||,,,,)),)}))})}.))))))},}}})}))))){{,..{{{{,{,{.||||,..},,..|||}..,)))})|||||}}||||}}}|||},......})).,,,,.}))))))})))},......)))}......||||}}}||,|},.|}}..............}}}}}))}},{((((,.||,||||{{{|||||||||}}||..||,||,...||}}},,,,,)}})))},})))}{{{{{||||,|{..,)),))).))})},.))})))))
Forensic Context

No forensic context available.