Basic Information
Symbol
hsa_ASTN1_0001100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111279
hsa_circASTN1_022
hsa-ASTN1_0017
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176837980-176863966
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176868844-176894830
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-344.50 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-359.30 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
237.06
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(....((((((......((((((((.(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).)))).))))))))..((.....)).(((((.((((((.(((.((.(((((((((...(((..((((((......)))))))))..(((((((...((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))).))...)))))..))))).((((......))))......)))).)))))).)))))..))))))..(((...((.(((.((..(.(((((.......))))))..)).))).))...)))((.(((.((.((((((((.((.((.(((((((((((..((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((((....))))))).))))).....)))))))...............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))............))))).)).))))))))...........)))))...))))))..((((.((((.....((((((.((((....(((..((......(((.....))).....))))))))).))))))...)))))))).)).)).))))))))))))).)).)))))))..))))))))).))...((((.....))))...))).))).))))))))((((((..((((...(((........))).))))..))))))...(((((.....(((....((((((..(((((..((.....))..........)))))((((((((((...........)).))))))))....)))))).....))).....)))))...)))))).....)((((.(((.(((.......))).)))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
({{..{{,,,({{{{{.((({{(({.(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).||||{|},}}}||{{(({{{.,||,(({(({{({{(({({,{(({((({((({({{{(,..(((((((......))))))),,..,|||||{,..((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))),)}...)))))..))))).{(((.,,..,||}...,,,.)))).)))))).)))))..)))))).,,{|,..((.(((.{{..|.{((({.......})))))..}).))).)).,,})}||}||..,|}||{{{{||,|||||,(((((((((((..((((((((((.((((((((((((,(((((.(({{((((....))))))).))))).,...))))))).....,.........((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,..,}))),,..........))))).)))}})))))),..........)))))...))))))..{({(,{,,|,,,..{{{|||}||||,}},||,}}}}..,,..,,|,,,}}))).....,.)))||||.||||||{..||||||||{||,||{||||||}||}}||,}}..}}}}}}..}}})))))}.}),..}||,||}..,}|||,,},|,|||.}}}}}}}}((((((..((((...(((........))).))))..)))))).,.((({{,,..,(((....((((((..(((((..,,.....},..........)))))(((((((({{...........}}.))))))))....)))))).....))).,..})))))...))))),.}},,){{{|,|||}|||,..,,.})))})),))))
Forensic Context
No forensic context available.