Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0001300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111281 hsa_circASTN1_013 hsa-ASTN1_0037
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176837980-176934373 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176868844-176965237 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-764.80 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -800.63 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 406.94
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((.((((((.(...........).)))))).)).)(((((((((((((.((((((((((((........))))...........((((((..(((((((......)).)))))..))))))((((.(((((((((..(((.....)))((((..(((((((.....((((......).))).....))))))).))))..))))).)))).))))..(((((((.((((((.((((.......(((((((((.(((...)))..))))))))).((((((((((((((((.............)))))))).........))).)))))(((((((((..(((((((....(((.(((.(.((((((((..((((...)))).))).(((((((...(((.((((...(((.((.....)))))((((((.(((((((((((((.((((((.((.(((((((((.((((..((.(((((((.(.((((((((((...((((((..((......(((((((((.((...)).)))).)))))......))..)))).)).(((.(......))))(((..(((((((((((..(((((.(((((((.(..((((((...((.((((...))))..........(((.....)))(((((.((((((((...((.......(((((.((.((((((((((((.(((.(((((....((((.....((((((.....))))))....))))....))))).)))))(((...)))...))))))))))....)).)))))......)).)))))))).)))))...))...))))..))..).)))))))..)))))..)))...)))).))))))))))))))...((.((((....)))).))..(((..(((...((((((...)))))).)))..)))))).)))))))))).))))...))))..)))))..)).))))))..))))((((((..((.....))...))))))))))))))).)))))))))).)))..((.(((..((((((......))))))..))))).)))))))....))))).)...))).)))))))))).)))).)))))..)))).)))))).)))))))........((((...(((((....))))))))).(((........))).))).)))).).)))))))))((((((((..(((((...(((((((((.(((......)))..))))))))).((.(((((((((...(((..((((((......)))))))))..(((((((...((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))).))...)))))..))))).((((......))))......)))).)))))).)))))..))))))..(((...((.(((.((..(.(((((.......))))))..)).))).))...)))((.(((.((.((((((((.((.((.(((((((((((..((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((((....))))))).))))).....)))))))...............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))............))))).)).))))))))...........)))))...))))))..((((.((((.....((((((.((((....(((..((......(((.....))).....))))))))).))))))...)))))))).)).)).))))))))))))).)).)))))))..))))))))).)))))))...))))).)))..((((.....(((((..((((((..((((...(((........))).))))..))))))...(((((.....(((....((((((..(((((..((.....))..........)))))((((((((((...........)).))))))))....)))))).....))).....)))))...)))))(((((((((.((...)).))).)))))).))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((.((((((.{...........}.)))))).)).)(((((((((((((.((((((((((((........)))),..........((((((..(((((((......))))))))..))))))((((.(((((((((..(((....,)))((((..(((((((.{,..(({(......}.)})...}}))))))).))))..)))))}}))).))))..(((((((.((((((.((((..,..{.(((((((((.(((...})}..))))))))).|{{{{{{{((((((((...,....,....))))))))..,....,,))),))}}.,((((((((..(((((((....,(({(((,{.({(((,,,,,({{(,,.||||..,},,||||||...{{|,{||,...(((.((.....)))))((((((.(((((((((,{((.((((((.((.(((((((((.((((..((.(((((((,(,{{,(((((((..,({((((..((......(((((((((.({...)).)))).)))))......))..)))).)).{((.{{....,})}}.,,,.{{((((({(((..(((((.(((((((.,..{({(({...||,{{{.|||||}}..........(((.....)))(((({.(((((((({,.,,...,,,.{((((.((,((((((((((((.(((.(((((....((((...,.((((((.....)))))).}..))))....))))).))))).{,.,,|||.,.}|}})))))}...|||,|||}|......,}|)}))}))}.}))})||,}},,.,}})},,)},},)))))))..)))))..)))...)))).)})),}}))))))).,,((.((((....)))).))..(((..(((...((((((...)))))).}))..))).}),}))))))))).))))...))))..)))))..)).))))))..}))}((((((,,({.....))...))))))))))))))).))))))}))),)))...,.(((..((((((......))))))..))))},|||||,....,||}}}})}..},)})))))))))).)))).)))))..)))).)))))).)))))))...,,...((((...(((((....))))))))).(((........))).})).)))).).))))))))){(((((((..(((((...(((((((((.(((......)))..))))))))).((.(((((((((...((..{((((((......)))))))))..(((((((...((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))),)}...)))))..))))).{(((.,,..,||}...,,,.)))).)))))).)))))..))))))..{((...((.(((.((..(.(((((.......))))))..)).))).))...}}|((.(({{((.((((((((.((.((.(((((((((((..((((((((((.((((((((((((,(((((.(({{((((....))))))).))))).,...))))))).....,.........((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,..,}))),,..........))))).)))}})))))),..........)))))...))))))..((((.((((.....((((((.((((....(((..,,......(((.....))}.....,,))))))).))))))...)))))))).)).)).))))))))))))).)).}))))))..))))))))).)))))))...))))).))|..{{((.,...((((,..((((((..((((...(((........))).))))..)))))).,.((({{,,..,(((....((((((..(((((..,,.....},..........)))))((((((((({...........}}.))))))))....)))))).....))).,..})))))...})))){((((((((.((...)).))).)))))).))))))))
Forensic Context

No forensic context available.