Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0001900
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111282 hsa_circASTN1_021 hsa-ASTN1_0027
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176845673-176863966 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176876537-176894830 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-286.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -300.00 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 138.46
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......((((((.(((..((..(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).(((((......(((((((((.((((((.(((....((((..(((((((.(((.(((((...(((((((......))))))).....)))))....((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))).))...)))))..))))).((((......))))......)))).)))))).)))))..)))))).(((.(.(((.(((.....))).))).).)))..((((((...)).)))).))))))))))...))))....)))))))))(((((((((((..((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((((....))))))).))))).....)))))))...............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))............))))).)).))))))))...........)))))...))))))..((.((...)))).....)))))))))))))).))))..))....))))))))).......)))((.((.(((((((.((((..........((((((((((.((((.(..(((...(((.((((........)))).)))....)))..)...)))).)))))))))))))).)))).))).)).))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,.....((((((.(((..((..(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).((((({.....{((((((((.((((((.(((.{..((((..(((((((.(((.(((((...(((((((......))))))).....))))},{..((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))),)}...)))))..))))).{(((.,,..,||}...,,,.)))).)))))).)))))..)))))).|,{||.,((.(((.,,..|}|{|||...,,..,|||)},.,},)})})).}}})))))))...))))..,.)))))))))(((((((((((..((((((((((.((((((((((((,(((((.(({{((((....))))))).))))).,...))))))).....,.........((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,..,}))),,..........))))).)))}})))))),..........)))))...))))))..,{,{{...)))).....)))))))))))))).))))..))....))))))))).....,.)))((.((.(((((((.(((({,(,,,.,({((,({(((((.{(({.,..{{{...{{{.{{{|.....,,.}))).))),..})))....,,}}||,},,))))))))))).)))),,)).)).))
Forensic Context

No forensic context available.