Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0002200
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111285 hsa_circASTN1_020 hsa-ASTN1_0016
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176851995-176863966 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176882859-176894830 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-242.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -253.67 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 102.51
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((.......((((((.(((..((..(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).(((((......(((((((((.((((((.(((....((((..(((((((.(((.(((((...(((((((......))))))).....)))))....((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))).))...)))))..))))).((((......))))......)))).)))))).)))))..)))))).(((.(.(((.(((.....))).))).).)))..((((((...)).)))).))))))))))...))))....)))))))))(((((((((((..((((((((((.((((((((((((.(((((.(((.((((....))))))).))))).....)))))))...............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))............))))).)).))))))))...........)))))...))))))..((.((...)))).....)))))))))))))).))))..))....))))))))).......))).((.................)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((.,.....((((((.(((..((..(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).((((({.....{((((((((.((((((.(((.{..((((..(((((((.(((.(((((...(((((((......))))))).....))))},|..((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))),)}...)))))..))))).{(((.,,..,||}...,,,.)))).)))))).)))))..)))))).|,{||.,((.(((.,,..|}|{|||...,,..,|||)},.,},)})})).}}})))))))...))))..,.)))))))))(((((((((((..((((((((((.((((((((((((,(((((.(({{((((....))))))).))))).,...))))))).....,.........((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,..,}))),,..........))))).)))}})))))),..........)))))...))))))..,{,{{...)))).....)))))))))))))).))))..))....))))))))).....,.))).((.....{{....}}....)).
Forensic Context

No forensic context available.