Basic Information
Symbol
hsa_chr1_0345700
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0111286
hsa_circASTN1_002
hsa-ASTN1_0077
Host gene
Astn1
Type of circRNA
Intergenic-Intergenic
Location (GRCh37)
1:176881241-176882141
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176912105-176913005
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-205.00 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-225.79 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
238.69
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
....(((......((((...(((((..(((.((.((((((((..((......((((((......)))))).))..)))))))).)).))))))))....(((((((((.....(((((((((((..(((.(((.((((((..(((((((((((...)))(((((.((((..............))))))))).((.(((((((.(((((.((....))))))).))))))).)).........((((((((..((((((......))))))..)))))))))))))).)).)))))).))).)))))))).(((((((((((...........)))))))))))....(((((...)))))(((...........))).(((((.....))))).))))))......)))))))))(((((..(((((.........(((((....((((((((...(((((..((..............))..)))))..)))))))))))))...((((((((((.((......)).))))))))))...(((((..............))))).......................((((.........))))..))))))))))((((((((((..(((.(((((((((((((.....(((((.......(((((((((((..((((((......(((((.((((((((............)))))))))))))....((((.....))))......((((.(((((.........))))).)))).........))))))......)))))))).))).......))))).......)))))))))...(((((((......))...)))))..)))))))))))))))))....)))))))....
Thermodynamic Ensemble Prediction
,,,.{((.,....{{{({{{((((,((((({((.((((((((,,{{.,,||.,{({{{.,.|,|}}}}|}.,}..}))))))),||{||..}))))}..(((((((((.,,.,((((,..,,,,.,|||.|||,{,,,,{..(((((,(((((..,{{(((((,,((((......,,,.....}}}}})))).||.{((((((.(((((.{{....))))))).))))))|{||{,.,.....((((((((..((((((......))))))..)))))))).|||||{||..,...}}}...,,..,,...(((((((((((..,.....,..)))))))))))....{{,,....,)))))}}},.........}}|}}}}}}.},},.,,),)))))))))}...))))))))),||{{..{{||{,,,.......,||||,..|||||.,}}.}||}}}.})|,)}}}}..{{(((({,....,))))))),}}}}}.|{{,{.{(((((((((.((......)).)))))))))}...(((((..............))))},||||,..,,,,,|},}......{{{{........,)))},})}},,,,|||((((((((((..(((.(((((((((((((.....(((((.......(((((((((((,.((((((..,{{.(((({{((((((((...{,....,,.))))))))))))).}}.((((.....))))......(((,{(((((,........})),)})))),.,......))))))...,..)))))))).))).......))))).......))))))))}...(((((({......))...)))))..}))))))))))))))))....,))),,),,,}
Forensic Context
No forensic context available.