Basic Information
Symbol
hsa_ABCA1_0013800
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0087819
hsa_circABCA1_001
Host gene
ABCA1
Type of circRNA
Exon-Intergenic
Location (GRCh37)
9:107651383-107690527
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
9:104889102-104928246
UCSC (hg38)
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-212.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-222.47 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
201.74
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
((.((.((((((((....))))).(((((..(((.....)))..))))).(((((((((.......((((..((((..(((........)))..))))..((.(((.(((((((((((((((..((((((((((((((((....(((((((..((((.((((((((((.(((((.((....)).))).)).((((((((((....(((((.((...)).)))))........))))))))))((((((((((((....)))))(((....)))....)))))))..(((.....(((....))).......)))..........((((((......)))))).))))).))))).)))).((((.((((((.(((.....))))))))).))))..)))))))..)))))))..((((((....))))))))).)))))).......((((((((((.((..((((....)))).....)).))))))))))))))))).)))))))).)))))..)))).......))))))))).....))).))))((...........))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((,((.((({((((.{{{{||||.(({({..(({...,|))},,))|||.({{(({{{(.......{{{{....(({{(((,.....,{|{|...|||{.,{.,,{.||||{||||||||||}}{((({((((({{{(((.,,,({(((({,,({{{.{|||{||||{|||||||{{.||,)}|))}.}},((((((((((....(((((.((...)).)))))........))))))))))|(((((((((({.,,.}},}}{{{,..,,})}}..))))}},,,|,|,,...{{{....}||,....{,||,...,...,,|({(((({,,..})))))).)))})}}}))),)}}).{(((.((((((.(((.....))))))))).)))|,,||||}||,,,}}}})),,,{||||,,,.)))))}))).)}))}).,,....|(((((((((.{(..((((....})))..,,.}}.))))))))))))))))},}},}}},))))}))}.)))).......}}))))))).,},.))).)))){{,..,,......})
Forensic Context
No forensic context available.