Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0002300
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ASTN1_0064
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176851995-176915256 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176882859-176946120 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-467.40 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -487.25 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 220.76
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(.((((((.((((......(((.((((((.(((.(......)))).).)).))).)))....))))((((((........((((((..(((.....)))))))))........))))))(((((((((((((((((((..............))))))))((((((((.((.(((.(((((....((((.....((((((.....))))))....))))....))))).)))))....(((((((.((((((...(((((....(((((.....((((((((((.(((.(((....((((..((((((((((....(((.(((((.(.(((((((...(((.((.((((.(((((.(((((..((.(((((((..(((((((((((.((((..((((...............)))).))))...))))))...(((...)))..((((...(((.((((((.....)))))).))).....))))((((((((((((.(((.((..((((..((((((..((((((......))))))..)))....)))......))))..)).))).....))))))))))))..(((((..(((((.((...((....)).....)))))))...))))).((((((((.(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).)))).))))))))((((.(((((.....(((((.(((((((.((((.((..(((((((...(((((((......))))))).....))))(((..((((((((((((((((((((((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))).))...)))))..))))).((((......))))......)))).)))))).)))))..))))))....))).))).)).))))))))))))))))))))).))))..)))))..)))...))))))......)))))...))))).)))).)).)))))))))).).)))))))).......(((((.(((.((((....))))))).)))))...))))))).))).............((((((((((.((.....))..)))).))).)))(((((....)))))...(((........)))......)))).))).))).))))))).)))...)))))..)))))..)))))).)))).)))......))))).)))...))))))))))).....)))))))((.................)).
Thermodynamic Ensemble Prediction
(.((((((.((((......(((.((((((.(((.(,....,)))).},)).))).)))....))))((((((...{,..,((((({.,{((.....))))))))),...,,..))))))(((((((((((((((((((..............))))))))((((((((.((.(((.(((((....((((...,.((((((.....)))))).}..))))....))))).)))))...{(((((((.((((((.,.{((((....(((((.....((((((((((.(((.(((,.,,{(({..((((((((((....(((.(((((.{.(((((((...(((.((.((((.(((((.(((((..((.(((((((..(((((((({{({((((,.,,||}}},......,,,.,|}||{|,,,...,,)))),,{(((...|....,|{,..}|||{(((((({{{{{,|||,,.,})}...}))))((((((((((((.(((.((..((((..{{,(((..((((((......))))))..))).,..)),......))))..)).}}}..,,.))))))))))))..{((,({{((,((......||.}}}))..,},,.,,,))}}})),,..((((((((.(((((((........)))..((((.((..((((...)))).)).)))).)))).))))))))((((.(((((.....(((((.(((((({,((((.((.{(((((((...(((((((......))))))).....)))}(((.,(((((((((((((((((({(((((((.(((((((.((((.((..(((.((.....((...........)).....)).)))..))..)))),)}...)))))..))))).{(((.,,,.,|}},..,,,,)))).)))))).)))))..)))))},,..))),)))})).))))))))))))))))))))).))))..)))))..)))...))))))......)))))...))))).)))).)).)))))))))).}.)))))))).....,.(((((.(({{((((....))))))).)))))...})))))).)))...,.........((((((((((.(,,....)).,)))).))).))){{{((,,,.}})))}}.{{,...,,,,,})}.}}}},)})).))).))).))))))).)))...)))))..))))).,)))))).)))).)))}.....))))).)))...))))))))))).....))))))){{.....{{....}}....)}.
Forensic Context

No forensic context available.