Basic Information
Symbol
hsa_ASTN1_0005000
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ASTN1_0010
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176905402-176934373
UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:176936266-176965237
UCSC (hg38)
External Database
Secondary Structure
Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-337.70 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy:
-353.62 kcal/mol
Frequency:
0.0000
Diversity:
318.52
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((((((((.(...........).)))))).....((((((((((((.(((..((((((((........))))...........((((((..(((((((......)).)))))..))))))..((((((((....((((.(((((((((.....((((.(((((...(.((..((((......))))..)).)...))))))))))))))).((((((..((((....))))))))))((((.(((((((((.(((...)))..)))))))))..)).))..((((((((.............))))))))......))).)))).......))))))))(((...((((((.((((((.....(((.(((((((...(((((.(((.((.((((....))))))....(((((((((((((((.(.((((((..((((((........))))))))))))..(((((((.....)).)))))((.....)).).)))))..((((((.....(((((((((.((...)).)))).))))).))))))...))))))).)))..((....)).......))).)).)))..))))))))))..))))))))))))..))))))).)))))))).)))))))..........((.((...((((((((..............))))))))....)).))((.(((.(((((....((((.....((((((.....))))))....))))....))))).)))))..)))))((((.((((((((((((((((((((((..(((...((((((((((.((..((..(........)..)).)).)))))..)))))....))).))))))..........))))))((.((((....)))).))..(((..(((...((((((...)))))).)))..))).))))))))))...))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
(((((((((({.,...........}.)))))}.....(((((((((((({(((..((((((((........)))}|.{{{{.....((((((..(((((((......))))))))..))))))..,,||||,||..{(((({{,.{{|||(,,,..(((({(((((..,(,(,..{{{|.,.,..}))),,)),).,,))}})}))}||||}|.((((((..((((....))))))))))||||.(((((((((.(((...)))..))))))))),{||,,,|,((((((((...,....,....))))))))......,}}}}|||.....}}),}))},,|||}}.((((((.((((((.....(((.(((((((...(((({.{({,{{||{(({{{((({{{{.{{{,,(((,,.(((((({,,...{|||}}|.|||,}},..}}}))))}.}))}}}}}||{|||,,,||.|..|||||{{,{{{.||||.,|{|{{{({{((,.....(((((((((.({...)).)))).))))).}}}}})}..))))})).|||.|||,.,,)),,..,|.}}}.}),)}}..))))))))))..))))))))))))..})}}))).)))))))).))))))).(((,....))}|{{{,||{|{{((({{.....,||||,||||||}}||,||,.,}}((.(((.(((((....((((...,.((((((.....)))))).}..))))....))))).)))))..}}|||({{(.(((((({{({({{((((((({{..{{{...|||||,||{|.,|||||.|,,}},},,.)}}}},})|}))))..})))),},,),,.||})}}.,,,,,..,.)))}}|{{.((({..,,)))),))..{{|,,|||,,,((((((...)))))).}}}..))).))))))))))}},))))
Forensic Context
No forensic context available.