Basic Information

Symbol
hsa_ABCC1_0016100
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa_circ_0038130 hsa_circABCC1_070 hsa-ABCC1_0028
Host gene
ABCC1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
16:16177223-16184445 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
16:16083366-16090588 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-197.60 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -205.77 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 109.35
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
(((((.(((((......))))).(((((((((........(((.(((.((((.((...((((((.....))))))...))))))))).)))(((((......))))).)))))))))(((((.(((((((.((((...(((((........)))))....))).).)))).))).))))).....((.....))(((((((...((.....))...)))))))))))).(((.((((...((((((.......((((((...(((((((....(((.(((....))))))(((..(((((((........))))).))..)))..)))))))..)))))).(((((......))))))))).))..(((....))).((((((((.....((((.......)))).......)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).....((((((.(((...((.((.....)).))...))))))))).)))).)))
Thermodynamic Ensemble Prediction
((({(,(((((......))))).(((((((((,..{{,..,{|.{{{.((((.{(...((((((.....))))))...)))))))}}.},|{{{((......})))},)))))))))(((((.(((((((.((((...,((({.{,,....)))}}.,,,))).).)))).))).))))).....((.....))(((((((...{.,,...,,.}})))))))))))).(((.((((...{((({(.......((((({...(((((((....{{{,{{{...,}}}||,(((..(((((((........))))).))..)))},)))))))..)))))).{{{{{.,,,,,}}}}})))},))..{{{..,.}}}.((((((((...,.((((.......)))).,.....)))))))).((((.(((...(((((((...))))))).....)))))))(((((....))))).||||((((((.(((...((.{{.....)),)).,,))))))))).)))).)))
Forensic Context

No forensic context available.