Basic Information

Symbol
hsa_ASTN1_0007600
RNA Class
transcript (circRNA)
Alias
hsa-ASTN1_0018
Host gene
ASTN1
Type of circRNA
Exon-Exon
Location (GRCh37)
1:176992516-177001985 UCSC (hg19)
Location (GRCh38)
1:177023380-177032849 UCSC (hg38)
External Database

Secondary Structure

Generated by RNAfold
Minimum free energy (MFE) structure:
Secondary structure that contributes a minimum of free energy.
Ensemble properties:
Thermodynamic properties of the Boltzmann ensemble.
Minimum free energy
-358.10 kcal/mol
Thermodynamic ensemble
Free Energy: -377.44 kcal/mol
Frequency: 0.0000
Diversity: 233.09
MFE Structure Visualization
Structure Prediction
MFE Structure Prediction
.(.(((......))).).(((((((((.....(((((.(((((.............)))))))))).(((((...((((((.((.(((((((((......((.(((((((.(((((..((((((..(((.............))).)).)))).)))))(((((.(..((((....))))..)..)))))((((((((((((((.......)))))......(((.(((((((........)))))))..))).(((...(((((.(.....((((((........))))))(((((.((((((.((((((((((.((.......(((((.(((((((((((((((......)).)))).))).........(((((((.(((((.(((..((...(((((((..((...)))))))))..))......(((((........)))))....((.((...((((.......))))..)).)).........(((((.((.(((((.((..((...(((...(((((......((((....((((((.(((.(((((.........))))))))(((((.(.....).)))))........))))))...))))......))))))))..)).)).))))).)))).)))))))))))))))))).(((..(((........)))...))).......(((.......)))))))))))))).....)).)))))))).)))))..))).)))))).)))))...))).)))))))))..))).))))))....)))).))))).))))......((((((((((((((((((((((...))))...))))))(((((((.....)).))))).)))))).))))))...(((((.((.((((((((.((((....)))))))))).)))).)))))..........(((....)))(((........))).))))...))))))))))))))
Thermodynamic Ensemble Prediction
{({((,....,}))){|{(((((,,,,.....(((((.(((((..,.......,..)))))))))),(((((...({(((((((,(((((((((..,(,.((.(((((((.(((((..(((({{..{{(,.......,,.},,,},)).)))).)))}}(((((.{,.((((....))))..)..))))){(((((((((((((.......)))))...,..(((.(((((((........)))))))..))).,|{,,.(((((.{.....((((((........))))))(((((.(((((,{((((((((((.((...(,..(((({{((((((((((((({(......,).)))).))).........(((((((.(((((.{{{..{(,,.(((((((..{{...)})))))))..}}.....,(((,,......,.)),}|,{,,{..{{..,||||.......}}}}.,},..},..,,{..{(((((.((.(((((.((...,.{((((.(((((,,........{({....)))}}}})))).}))}},..,({((({(((,..((((....{(((((((..............))).)))))....))))))))))}.)).)).))))).)))).))))}))))))))))))).{{{..(((........)))...))).......{((.......))})))))))))))...}.)).)))))))).)))))..))).)))))}.)))))...}},.))))))))},,))},))))})....)))}.})))).)}}|,...,,{{((((((((((((((((((((...))))...)))))}(((((((.....)).))))),)))))).)))))),..(((((.((.((((((({{((((....)))))))))).)))).))))).....,,,..{((....)}},,,.......,))).)))),..))))))))))))))
Forensic Context

No forensic context available.